Preview

Acta Biomedica Scientifica

Расширенный поиск

ХАРАКТЕРИСТИКА БАЙКАЛЬСКОГО СУБТИПА ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ЦИРКУЛИРУЮЩЕГО НА ТЕРРИТОРИИ ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ

https://doi.org/10.29413/ABS.2018-3.4.9

Полный текст:

Аннотация

Введение. В ходе проведения цикла работ по исследованию генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) на территории Восточной Сибири выявлена группа из  22 штаммов, обладающих уникальной генетической структурой, существенно отличающейся  от всех известных генотипов/субтипов ВКЭ. Этот вариант ВКЭ получил  предварительное название «группа 886» или генотип 5 ВКЭ. В связи с существованием  оригинального варианта ВКЭ необходимо исследование генетических, биологических  свойств штаммов «группы 886», уточнение его таксономического статуса ВКЭ, ареала, эволюционной истории и т.д.

Цель. Обобщение всего имеющегося на сегодняшний день материала о генетических, биологических свойствах ВКЭ «группы 886».

Материалы и методы. С помощью комплекса молекулярно-генетических методов (МГНК, секвенирование фрагментов или полного генома штаммов ВКЭ) исследована генетическая  структура штаммов «группы 886».

Результаты. Показано, что штаммы «группы 886» формируют отдельный кластер на филогенетическом древе, уровень генетических отличий от других генотипов составляет  более 12 %. Установлено, что данный вариант ВКЭ имеет собственный ареал (Иркутская  область, Республика Бурятия, Забайкальский край, Северная Монголия). Доказаны его  экологическая связь со всеми звеньями трансмиссивной цепи (иксодовые клещи, мелкие  млекопитающие, человек), участие в патологии человека, стабильность и длительность циркуляции на территории Байкальского региона, индивидуальная  эволюционная история. Рассмотрены некоторые фенотипические характеристики штаммов «группы 886», свидетельствующие о высоком патогенном потенциале этого варианта ВКЭ и  его способности приспосабливаться к циркуляции в разных биоценозах и в различных ландшафтно-географических зонах.

Выводы. Представленные данные свидетельствуют в пользу правомерности аттестации «группы 886» в качестве самостоятельного генетического типа – генотипа 5. Учитывая  географическое распространение данного генотипа ВКЭ, мы предлагаем присвоить ему  название «Байкальский генотип/субтип». 

Об авторах

И. В. Козлова
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия


Т. В. Демина
ФГБОУ ВО «Иркутский государственный аграрный университет им. А.А. Ежевского»
Россия
664038, г. Иркутск, п. Молодёжный, Россия


С. Е. Ткачев
ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН
Россия
630090, г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 8, Россия


Е. К. Дорощенко
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия


О. В. Лисак
ФГБОУ ВО «Иркутский государственный аграрный университет им. А.А. Ежевского»
Россия
664038, г. Иркутск, п. Молодёжный, Россия


М. М. Верхозина
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области»
Россия
664047, г. Иркутск, ул. Трилиссера, 51, Россия


Л. С. Карань
ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
111123, г. Москва, ул. Новогиреевская, 3a, Россия


Ю. П. Джиоев
Научно-исследовательский институт биомедицинских технологий Иркутского государственного медицинского университета
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1/3, Россия


А. И. Парамонов
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия


О. В. Сунцова
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия


Ю. С. Савинова
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия


О. О. Черноиванова
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия


D. Ruzek
Исследовательский институт ветеринарии
Чехия
62100, Брно, ул. Худкова, 70, Чешская Республика


Н. В. Тикунова
ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
111123, г. Москва, ул. Новогиреевская, 3a, Россия


В. И. Злобин
Научно-исследовательский институт биомедицинских технологий Иркутского государственного медицинского университета
Россия
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1/3, Россия


Список литературы

1. Андаев Е.И., Сидорова Е.А., Борисова Т.И., Трухина А.Г., Карань Л.С., Погодина В.В., Туранов А.О., Адельшин Р.В., Нагибина О.А., Вершинин Е.А. Клещевой энцефалит в Забайкальском крае и молекулярно-биологическая характеристика возбудителя // Национальные приоритеты России. – 2011. – № 2 (5). – С. 148–149. Andaev EI, Sidorova EA, Borisova TI, Trukhina AG, Karan LS, Pogodina VV, Turanov AO, Adelshin RV, Nagibina OA, Vershinin EA. (2011). Tick-borne encephalitis in the Trans-Baikal region, and molecular- biological characteristics of the pathogen [Kleshchevoy entsefalit v Zabaykal’skom krae i molekulyarno-biologicheskaya kharakteristika vozbuditelya]. Natsional’nye prioritety Rossii, 2 (5), 148-149.

2. Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М., Козлова И.В., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Злобин В.И. Генетическая вариабельность и генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью дезоксиолигонуклеотидных зондов // Вопросы вирусологии. – 2009. – № 3. – С. 33–42. Demina TV, Dzhioev YuP, Verkhozina MM, Kozlova IV, Tkachev SE, Doroshchenko EK, Lisak OV, Zlobin VI. (2009). Genetic variability and genotyping of tick-borne encephalitis virus with desoxyoligonucleotide probes [Geneticheskaya variabel’nost’ i genotipirovanie virusa kleshchevogo entsefalita s pomoshch’yu dezoksioligonukleotidnykh zondov]. Voprosy virusologii, (3), 33-42.

3. Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Верхозина М.М., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Парамонов А.И., Злобин В.И. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов и возможный сценарий их формирования // Вопросы вирусологии. – 2012. – № 4 (57). – С. 13–19. Demina TV, Dzhioev YuP, Kozlova IV, Verkhozina MM, Tkachev SE, Doroshchenko EK, Lisak OV, Paramonoa AI, Zlobin VI (2012). Genotypes 4 and 5 of tick-borne encephalitis virus: stryctural features of genomes and a possible scenario for their formation [Genotipy 4 i 5 virusa kleshchevogo entsefalita: osobennosti struktury genomov i vozmozhnyy stsenariy ikh formirovaniya]. Voprosy virusologii, 4 (57), 13-19.

4. Злобин В.И., Демина Т.В., Беликов С.И., Бутина Т.В., Горин О.З., Адельшин Р.В., Грачев М.А. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента белка оболочки // Вопросы вирусологии. – 2001. – № 1. – С. 17–22. Zlobin VI, Demina TV, Belikov SI, Butina TV, Gorin OZ, Adelshin RV, Grachev MA. (2001). Genetic typing of TBEV strains in terms of homology analysis of an envelope proteins gene fragment [Geneticheskoe tipirovanie shtammov virusa kleshchevogo entsefalita na osnove analiza gomologii fragmenta belka obolochki]. Voprosy virusologii, (1), 17-22.

5. Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Козлова И.В. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. – Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2003. – 272 с. Zlobin VI, Belikov SI, Dzhioev YuP, Demina TV, Kozlova IV. (2003). Molecular epidemiology of tick-borne encephalitis [Molekulyarnaya epidemiologiya kleshchevogo entsefalita]. Irkutsk, 271 p.

6. Карань Л.С., Маленко Г.В., Бочкова Н.Г., Левина Л.С., Ливанова Г.П., Колясникова Н.М., Гамова Е.Г., Трухина А.Г., Злобин В.И., Верхозина М.М., Козлова И.В., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Погодина В.В. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. – 2007. – № 4. – С. 34–40. Karan LS, Malenko GV, Bochkova NG, Levina LS, Livanova GP, Kolyasnikova NM, Gamova EG, Trukhina AG, Zlobin VI, Verkhozina MM, Kozlova IV, Dzhioev YuP, Demina TV, Pogodina V.V. (2007). The use of molecular genetic techniques to study the structure of tick-borne encephalitis virus strains [Primenenie molekulyarno-geneticheskikh metodik dlya izucheniya struktury shtammov virusa kleshchevogo entsefalita]. Byul. SO RAMN, (4), 34-40.

7. Погодина В.В., Фролова М.П., Ерман Б.А. Хронический клещевой энцефалит. – Новосибирск: Наука, 1986. – 233 с. Pogodina VV, Frolova MP, Erman BA. (1986). Chronic tick-borne encephalitis [Khronicheskiy kleshchevoy entsefalit]. Novosibirsk, 233 p.

8. Трухина А.Г., Чипанин В.И., Воронко И.В. Результаты изучения биологических свойств и особенностей циркуляции вируса КЭ серотипа Айна/1448 в Прибайкалье // Этиология, эпидемиология и диагностика инфекционных заболеваний Восточной Сибири. – Иркутск, 1992. – С. 84–91. Trukhina AG, Chipanin VI, Voronko IV. (1992). The results of studying biological properties and peculiarities of the circulation of the «Aina/1448» serotype TBE virus in the Baikal region [Rezul’taty izucheniya biologicheskikh svoystv i osobennostey tsirkulyatsii virusa KE serotipa Ayna/1448 v Pribaykal’e]. Etiologiya, epidemiologiya i diagnostika infektsionnykh zabolevaniy Vostochnoy Sibiri, 84-91.

9. Dai X, Shang G, Lu S, Yang J, Xu J. (2018). A new subtype of eastern tick-borne encephalitis virus discovered in Qinghai-Tibet Plateau, China. Emerg Microbes Infect, 71-74.

10. Ecker M, Allison SL, Meixner T, Heinz FX. (1999) Sequence analysis and genetic classification of tick-borne encephalitis viruses from Europe and Asia. J Gen Virol, 80 (1), 179-185.

11. Grard G, Moureau G, Charrel RN, Lemasson JJ, Gonzalez JP, Gallian P, Gritsun TS, Holmes EC, Gould EA, de Lamballerie X. (2007). Genetic characterization of tick-borne flaviviruses: new insights into evolution, pathogenetic determinants and taxonomy. J Virology, 361, 80- 92.

12. Heinz FX, Collet MS, Purcell RH, Gould EA, Howard CR, Houghton RJ. (2000). Family Flaviviridae. Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: 7 reports of the International committee of taxonomy of viruses. San Diego, 859-878.

13. Heinze DM, Gould EA, Forrester NL (2012). Revisiting the clinal concept of evolution and dispersal for the tick-borne flaviviruses by using phylogenetic and biogeographic analyses. J Virol, 86 (16), 8663-8671.

14. Herrington C., McGee J. (Ed.) (1999) Clinical molecular diagnostics: method. 558 p.

15. Khasnatinov MA, Danchinova GA, Unursaikhan U. (2009). Characterization of tick-borne encephalitis virus that caused the lethal meningoencephalitis human in Mongolia. Inter. Conference Zoonotic Infections Disease and Tourism. Ulaanbaatar, 88-93.

16. Kovalev SYu, Mukhacheva TA. (2017). Reconsidering the classification of tick-borne encephalitis virus within the Siberian subtype gives new insights into its evolutionary history. Infection, Genetics and Evolution, (55), 159-165.

17. Kozlova IV., Verkhozina MM, Demina TV, Dzhioev YuP, Tkachev SE, Karan LS, Doroshchenko EK, Lisak OV, Suntsova OV, Paramonov AI, Fedulina OO, Revozor AO, Zlobin VI. (2013). Genetic and biological properties of original TBEV strains group circulating in Eastern Siberia. Encephalitis. InTech. Croatia, 95-112.

18. Pletnev AG, Yamshikov VF, Blinov VM. (1990). Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-borne encephalitis virus. Virology, (174), 250-263.

19. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. (2011). MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology and Evolution, 28 (10), 2731-2739.


Для цитирования:


Козлова И.В., Демина Т.В., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Верхозина М.М., Карань Л.С., Джиоев Ю.П., Парамонов А.И., Сунцова О.В., Савинова Ю.С., Черноиванова О.О., Ruzek D., Тикунова Н.В., Злобин В.И. ХАРАКТЕРИСТИКА БАЙКАЛЬСКОГО СУБТИПА ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ЦИРКУЛИРУЮЩЕГО НА ТЕРРИТОРИИ ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ. Acta Biomedica Scientifica. 2018;3(4):53-60. https://doi.org/10.29413/ABS.2018-3.4.9

For citation:


Kozlova I.V., Demina T.V., Tkachev S.E., Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Verkhozina M.M., Karan L.S., Dzhioev Y.P., Paramonov A.I., Suntsova O.V., Savinova Y.S., Chernoivanova O.O., Ruzek D., Tikunova N.V., Zlobin V.I. CHARACTERISTICS OF THE BAIKAL SUBTYPE OF TICK-BORNE ENCEPHALITIS VIRUS CIRCULATING IN EASTERN SIBERIA. Acta Biomedica Scientifica. 2018;3(4):53-60. https://doi.org/10.29413/ABS.2018-3.4.9

Просмотров: 208


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2541-9420 (Print)
ISSN 2587-9596 (Online)