СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИХ СВОЙСТВ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ, ВХОДЯЩИХ В РАЗЛИЧНЫЕ ВАРИАНТЫ ОБОЛОЧЕЧНОГО БЕЛКА E ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА
Аннотация
Рассматривается вариабельность основного антигенного белка E различных штаммов вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) на уровне физико-химических свойств аминокислотных остатков. Оценивалось разнообразие свойств аминокислот белка, участвующих во взаимодействии «антиген - антитело». Было охарактеризовано 180 вариантов белка E ВКЭ из базы NCB1, различающихся по физико-химическим свойствам аминокислотных остатков. Это означает, что среди природных вариантов ВКЭ могут потенциально обнаруживаться штаммы,ускользающие от иммунного ответа, вызванного стандартной вакциной.
Об авторах
Ю. С. Букин
Лимнологический институт СО РАН (; Национальный исследовательский Иркутский государственный технический университет
Россия
Россия
Ю. П. Джиоев
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека; Иркутский государственный медицинский университет
Россия
Россия
И. В. Козлова
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека
Россия
Россия
Д. Ружек
Институт паразитологии Биологического центра Академии наук Республики Чехия; Научно-исследовательский институт ветеринарии
Россия
Россия
В. И. Злобин
Иркутский государственный медицинский университет
Россия
Россия
Список литературы
1. Баженов А.И., Эльгорт Д.А., Фельдшерова А.А. Выявление антител к мутантным формам HBSAG у лиц, иммунизированных против гепатита B вакцинами разных субтипов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2011. - № 5. - C. 49-53
2. Воробьева М.С., Расщепкина М.Н., Ладыженская И.П. Вакцины, иммуноглобулины и тест-системы для профилактики и диагностики клещевого энцефалита // Вопросы вирусологии. - 2007. - № 6. - P. 30-36
3. Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Верхозина М.М., и др. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов возможный сценарий их формирования // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 4. - С. 13-19
4. Злобин В.И. Клещевой энцефалит в Российской Федерации: современное состояние проблемы и стратегия профилактики // Вопросы вирусологии. - 2005. - № 3. - C. 26-31
5. Парамонов А.И., Козлова И.В., Верхозина М.М., Джиоев Ю.П., и др. Генетическая и экологическая характеристика оригинального варианта вируса клещевого энцефалита («группа 886»), циркулирующего в Байкальском регионе // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. - 2013. - № 2, Ч. 2. - С. 124-129
6. Столбиков А.С., Букин Ю.С., Джиоев Ю.П, Злобин В.И. Биоинформационный поиск вариантов а-антигенной детерминанты белка S вируса гепатита B для создания поливалентной вакцины / / Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2014. - № 3. - C. 94-104
7. Goodman J.L., Dennis D.T., Sonenshine D.E. Tick-borne encephalitis. Tick-borne diseases of humans. - Washington, DC: ASM Press, 2005. - 151 p.
8. Demina T.V., Dzhioev Yu.P., Verkhozina M.M., Kozlova I.V. et al. Genetic variability research and genotyping of tick-borne encephalitis virus by means of desoxyoligonu- cleotide probes // Journal of Medical Virology. - 2010. - N 82. - Р. 965-976.
9. Kovalev S.Y., Mukhacheva T.A., Kokorev V.S., Belyaeva I.V. Tick-borne encephalitis virus: reference strain Sofjin and problem of its authenticity // Virus Genes. - 2012. - N 2. - P. 217-224.
10. Mathura V.S., Kolippakkam D. APDbase: Amino acid physicochemical properties database // Bioinformation. - 2005. - N 1. - P. 2-4.
11. Pele J., Jean-Michel Becu J., Abdi H., Chabbert M. Bios2mds: an R package for comparing orthologous protein families by metric multidimensional scaling // BMC Bionformatics. - 2012. - N 13. - P. 133.
12. Rey F.A., Heinz F.X., Mandl C., Kunz C., Harrison S.C. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2 are solution // Nature. - 1995. - N 375. - P. 291-298.
Рецензия
Для цитирования:
Букин Ю.С., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Ружек Д., Злобин В.И. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИХ СВОЙСТВ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ, ВХОДЯЩИХ В РАЗЛИЧНЫЕ ВАРИАНТЫ ОБОЛОЧЕЧНОГО БЕЛКА E ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА. Acta Biomedica Scientifica. 2014;(6):84-88.
For citation:
Bukin Yu.S., Dzhioev Yu.P., Kozlova I.V., Ruzek D..., Zlobin V.I. COMPARATIVE ANALYSIS OF THE PHYSICOCHEMICAL PROPERTIES OF AMINO ACID RESIDUES WITHIN THE VARIOUS EMBODIMENTS OF THE ENVELOPE PROTEIN E TICK-BORNE ENCEPHALITIS VIRUS. Acta Biomedica Scientifica. 2014;(6):84-88. (In Russ.)
Просмотров:
413
Послать статью по эл. почте 
