actabiomedicaActa Biomedica ScientificaActa Biomedica Scientifica2541-94202587-9596Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problemsactabiomedica-1843Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯ И ВИРУСОЛОГИЯMICROBIOLOGY AND VIRUSOLOGYСРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИХ СВОЙСТВ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ, ВХОДЯЩИХ В РАЗЛИЧНЫЕ ВАРИАНТЫ ОБОЛОЧЕЧНОГО БЕЛКА E ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТАCOMPARATIVE ANALYSIS OF THE PHYSICOCHEMICAL PROPERTIES OF AMINO ACID RESIDUES WITHIN THE VARIOUS EMBODIMENTS OF THE ENVELOPE PROTEIN E TICK-BORNE ENCEPHALITIS VIRUSБукинЮ. С.BukinYu. S.bukinyura@mail.ruДжиоевЮ. П.DzhioevYu. P.alanir07@mail.ruКозловаИ. В.KozlovaI. V.diwerhoz@rambler.ruРужекД.RuzekD. ..ruzekd@paru.cas.czЗлобинВ. И.ZlobinV. I.vizlobin@mail.ruЛимнологический институт СО РАН (; Национальный исследовательский Иркутский государственный технический университетLimnological Institute SB RAS; National Research Irkutsk State Technical UniversityНаучный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека; Иркутский государственный медицинский университетScientific Center of Family Health Problems and Human Reproduction; Irkutsk State Medical UniversityНаучный центр проблем здоровья семьи и репродукции человекаScientific Center of Family Health Problems and Human ReproductionИнститут паразитологии Биологического центра Академии наук Республики Чехия; Научно-исследовательский институт ветеринарииInstitute of Parasitology, Ceske Budejovice, Czech Republic; Veterinary InstituteИркутский государственный медицинский университетIrkutsk State Medical University201428112014068488Copyright © Букин Ю.С., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Ружек Д..., Злобин В.И., 20142014Букин Ю.С., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Ружек Д., Злобин В.И.Bukin Y.S., Dzhioev Y.P., Kozlova I.V., Ruzek D..., Zlobin V.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/1843

Рассматривается вариабельность основного антигенного белка E различных штаммов вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) на уровне физико-химических свойств аминокислотных остатков. Оценивалось разнообразие свойств аминокислот белка, участвующих во взаимодействии «антиген - антитело». Было охарактеризовано 180 вариантов белка E ВКЭ из базы NCB1, различающихся по физико-химическим свойствам аминокислотных остатков. Это означает, что среди природных вариантов ВКЭ могут потенциально обнаруживаться штаммы,ускользающие от иммунного ответа, вызванного стандартной вакциной.

The article considers variability of antigen protein E of different tick-borne encephalitis (TBE) strains at the level of physicochemical properties of amino acid residues. The authors evaluated variety of properties of protein amino acids involved in antigen-antibody interaction. 180 variants of TBEVE protein in database NCB1 were detected, differing in physical and chemical properties of amino acid residues. This implies that natural variants of TBEV strains can potentially be detected, that escaped from the immune response induced by standard vaccine.

ВКЭбелок оболочки Eвакцина противоклещевого энцефалитапротеомикаtick-borne encephalitis virusenvelope protein ETBE vaccineproteomicReferencesБаженов А.И., Эльгорт Д.А., Фельдшерова А.А. Выявление антител к мутантным формам HBSAG у лиц, иммунизированных против гепатита B вакцинами разных субтипов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2011. - № 5. - C. 49-53Баженов А.И., Эльгорт Д.А., Фельдшерова А.А. Выявление антител к мутантным формам HBSAG у лиц, иммунизированных против гепатита B вакцинами разных субтипов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2011. - № 5. - C. 49-53Воробьева М.С., Расщепкина М.Н., Ладыженская И.П. Вакцины, иммуноглобулины и тест-системы для профилактики и диагностики клещевого энцефалита // Вопросы вирусологии. - 2007. - № 6. - P. 30-36Воробьева М.С., Расщепкина М.Н., Ладыженская И.П. Вакцины, иммуноглобулины и тест-системы для профилактики и диагностики клещевого энцефалита // Вопросы вирусологии. - 2007. - № 6. - P. 30-36Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Верхозина М.М., и др. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов возможный сценарий их формирования // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 4. - С. 13-19Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Верхозина М.М., и др. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов возможный сценарий их формирования // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 4. - С. 13-19Злобин В.И. Клещевой энцефалит в Российской Федерации: современное состояние проблемы и стратегия профилактики // Вопросы вирусологии. - 2005. - № 3. - C. 26-31Злобин В.И. Клещевой энцефалит в Российской Федерации: современное состояние проблемы и стратегия профилактики // Вопросы вирусологии. - 2005. - № 3. - C. 26-31Парамонов А.И., Козлова И.В., Верхозина М.М., Джиоев Ю.П., и др. Генетическая и экологическая характеристика оригинального варианта вируса клещевого энцефалита («группа 886»), циркулирующего в Байкальском регионе // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. - 2013. - № 2, Ч. 2. - С. 124-129Парамонов А.И., Козлова И.В., Верхозина М.М., Джиоев Ю.П., и др. Генетическая и экологическая характеристика оригинального варианта вируса клещевого энцефалита («группа 886»), циркулирующего в Байкальском регионе // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. - 2013. - № 2, Ч. 2. - С. 124-129Столбиков А.С., Букин Ю.С., Джиоев Ю.П, Злобин В.И. Биоинформационный поиск вариантов а-антигенной детерминанты белка S вируса гепатита B для создания поливалентной вакцины / / Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2014. - № 3. - C. 94-104Столбиков А.С., Букин Ю.С., Джиоев Ю.П, Злобин В.И. Биоинформационный поиск вариантов а-антигенной детерминанты белка S вируса гепатита B для создания поливалентной вакцины / / Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2014. - № 3. - C. 94-104Goodman J.L., Dennis D.T., Sonenshine D.E. Tick-borne encephalitis. Tick-borne diseases of humans. - Washington, DC: ASM Press, 2005. - 151 p.Goodman J.L., Dennis D.T., Sonenshine D.E. Tick-borne encephalitis. Tick-borne diseases of humans. - Washington, DC: ASM Press, 2005. - 151 p.Demina T.V., Dzhioev Yu.P., Verkhozina M.M., Kozlova I.V. et al. Genetic variability research and genotyping of tick-borne encephalitis virus by means of desoxyoligonu- cleotide probes // Journal of Medical Virology. - 2010. - N 82. - Р. 965-976.Demina T.V., Dzhioev Yu.P., Verkhozina M.M., Kozlova I.V. et al. Genetic variability research and genotyping of tick-borne encephalitis virus by means of desoxyoligonu- cleotide probes // Journal of Medical Virology. - 2010. - N 82. - Р. 965-976.Kovalev S.Y., Mukhacheva T.A., Kokorev V.S., Belyaeva I.V. Tick-borne encephalitis virus: reference strain Sofjin and problem of its authenticity // Virus Genes. - 2012. - N 2. - P. 217-224.Kovalev S.Y., Mukhacheva T.A., Kokorev V.S., Belyaeva I.V. Tick-borne encephalitis virus: reference strain Sofjin and problem of its authenticity // Virus Genes. - 2012. - N 2. - P. 217-224.Mathura V.S., Kolippakkam D. APDbase: Amino acid physicochemical properties database // Bioinformation. - 2005. - N 1. - P. 2-4.Mathura V.S., Kolippakkam D. APDbase: Amino acid physicochemical properties database // Bioinformation. - 2005. - N 1. - P. 2-4.Pele J., Jean-Michel Becu J., Abdi H., Chabbert M. Bios2mds: an R package for comparing orthologous protein families by metric multidimensional scaling // BMC Bionformatics. - 2012. - N 13. - P. 133.Pele J., Jean-Michel Becu J., Abdi H., Chabbert M. Bios2mds: an R package for comparing orthologous protein families by metric multidimensional scaling // BMC Bionformatics. - 2012. - N 13. - P. 133.Rey F.A., Heinz F.X., Mandl C., Kunz C., Harrison S.C. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2 are solution // Nature. - 1995. - N 375. - P. 291-298.Rey F.A., Heinz F.X., Mandl C., Kunz C., Harrison S.C. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2 are solution // Nature. - 1995. - N 375. - P. 291-298.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.