DIVERSITY AND DISTRIBUTION OF INFLUENZA A VIRUSES AMONG WILD BIRDS IN EASTERN SIBERIA

Influenza A virus (IAV) is a worldwide pathogen of humans and animals. In nature IAV is associated with aquatic birds. The regular survey of natural populations of aquatic birds is important to describe the diversity of IAV, evaluate pathogenic potential of circulating strains for human and domestic animals and reveal possible routes of virus spread during seasonal migrations of wild birds. In this paper the results of annual ecological and viroiogicai survey among wild birds of Eastern Siberia performed between 2005 and 2012 are presented. The cloacal swabs and tissue samples from 901 wild birds were analyzed for presence of IAV using virus isolation in chicken embryos and/or PCR assay. The subtype of IAV was established using haemaggiutintion inhibition assay and genome sequencing. Seventeen subtypes of IAV were discovered including H1N1, H5N1, HswNl, H0N1, H1N4, HlNlsw, H2N2, H3N2, H3N5, H3N6, H3N8, H4N6, H7N1, H7N8, H10N7, H13N6, H13N8. Highest prevalence of infection was detected among wild ducks Anas crecca (18.3 %), A. platyrhynchos (13.8 %) and herring gull Larus argentatus (6.5 %). The most diverse virus population was revealed in Irkutsk Region among L. argentatus that hosted subtypes H3, H6N1 and H9. In the Republic of Tuva and Krasnoyarsk territory H3N8, H5N1 and H7 subtypes were detected. The wild birds from Republic of Khakassia were shown to hostH4 subtype, whereas in Republic of Buryatia subtypes H3 and H4 were detected in wild ducks and herring gulls. Possible routes of IAV spread and epidemiological implications are discussed.

Influenza A virus, bird species, diagnostics of influenza virus, distribution, bird migrations, Eastern Siberia, Central Siberia

1. Белов А.П., Огарков П.И. Зоонозный (птичий) грипп: опасности (взгляд эпидемиолога) // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2007. - №5 (22).-С. 3-8.

2. Горин 0.3.,Ямникова C.C., Моисеенко H.H., Гусарова Н.А., Ковшаров А.Ф., Чипанин В.И., Солнцев И.Г, Щепин А.Ю. Итоги исследований по экологии вируса гриппа А на юге Восточной Сибири//В кн.: Природноочаговые болезни человека. - Омск, 1991. - С. 110-117.

3. Данчинова Г.А., Хаснатинов M.A., Чапорги- на Е.А., Ляпунов А.В., Пыжьянов С.В., Арбатская Е.В., Глушенкова Т.В., Тупицын И.И., Шестопалов А.М., Кулак М.А. Распространенность вирусов гриппа Асреди птиц Восточной Сибири // Журнал инфекционной патологии. - 2009. - Т. 16, № 3. - С. 97-98.

4. Донченко A.C., Юшков Ю.Г., Марченко В.Ю., Шаршов К.А., Алексеев А.Ю., Ильиных Ф.А., Савченко И.А., Карпова Н.В., Савченко А.П., Шестопалов А.М. Результаты мониторинга вируса гриппа среди диких птиц на территории Красноярского края (2008 г.) // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. -2010.-№7.-С. 61-67.

5. Литвинова O.M., Смородинцева E.A., Деева Э.Г., Лобова Т.Г., Коновалова Н.И. Этиология современного гриппа // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2001. -№1. -С. 5-9.

6. Львов Д.К., Горин 0.3., Ямникова C.C., Злобин В.И., Львов Н.Д., Хаснатинов М.А., Федякина И.Т., Чумаков В.М., Непоклонов Е.А., Алипер Т.И. Изоляция вирусов гриппа А от диких птиц и ондатры в западной части Восточно-Азиатского миграционного русла // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 35-39.

7. Марченко В.Ю., Алексеев А.Ю., Ильиных Ф.А., Шаршов К.А., Савченко А.П., Карпова Н.В., Савченко И.А., Шестопалов А.М. Экология вируса гриппа в популяции диких птиц центральной Сибири [2008 г.) // Проблемы и перспективы современной медицины, биологии и экологии: международная телеконф. - Томск, 2010. - С. 79-80.

8. Марченко В.Ю.,Алексеев А.Ю.,Суслопаров И.М., Шаршов К.А., Ильиных Ф.А., Золотых С.И., Шестопалов А.М., Церенноров Д., Абмед Д., Дроздов И.Г., Отгон- баатар Д. Выделение вируса гриппа А от диких птиц на территории западной части Монголии // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии.-2010,-№ 6.-С. 18-21.

9. Об утверждении правил по борьбе с гриппом птиц // Приказ Минсельхоза РФ № 90 от 27.03.2006 г. - Режим доступа: http://www.mcx.ru/documents/ document/show/17439.156.htm.

10. Пыжьянов C.B., Пыжьянова C.C. Современное состояние большого баклана на Байкале и Хубсугуле (Монголия) // Известия ИГУ Серия «Биология. Экология». - 2010. - Т. 3, № 1. - С. 60-63.

11. Савченко А.П., Савченко П.А. Миграции птиц Центральной Сибири и распространение вирусов гриппа А: монография. - Красноярск: Сиб. федер. ун- т, 2014. - 256 с

12. Савченко А.П., Савченко П.А., Савченко И.А., Емельянов В.И., Карпова Н.В., Ляпунов А.В., Хасна- тинов М.А., Данчинова Г.А. Виды птиц - основные носители и переносчики вирусов гриппа А в Восточной Сибири // Бюлл. ВСНЦ СО РАМН. - 2015. - № 4 (104).-С. 102-111

13. Чапоргина E.A., Данчинова Г.А., Хаснати- нов М.А., Ляпунов А.В., Пыжьянов С.В., Арбатская Е.В. Распространение арбовирусов и вирусов гриппа в Прибайкалье // Бюлл. ВСНЦ СО РАМН. - 2012. - № 5 (87), Ч. 1.-С. 340-342.

14. Шаршов KA., Золотых С.И., Федоров Е.Г., Иванов И.В., Друзяка А.В., Шестопалов А.М., Нетесов С.В. Результаты мониторинга вируса гриппа птиц среди синантропных птиц в эпизоотический и постэпизоотический периоды на юге Западной Сибири // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2007. - № 4. - С. 53-56.

15. Bateman AC, Busch MG, Karasin AI, Bovin N, Olsen CW (2008). Amino acid 226 in the hemagglutinin of H4N6 influenza virus determines binding affinity for alpha2,6-linked sialic acid and infectivity levels in primary swine and human respiratory epithelial cells./. Virol., 82 (16), 8204-8209.

16. Jia N, de Vlas SJ, Liu YX, Zhang JS, Zhan L, Dang RL, Ma YH, Wang XJ, Liu T, Yang GP, Wen QL, Richardus JH, Lu S, Cao WC (2009). Serological reports of human infections of H7 and H9 avian influenza viruses in northern China./. Clin. Virol., 44 (3), 225-229.

17. Khanna M, Kumar P, Choudhary K, Kumar B, Vijayan VK (2008). Emerging influenza virus: a global threat/. Biosci., 33 (4), 475-482.

18. Langstaff IG, McKenzie JS, Stanislawek WL, Reed CE, Poland R, Cork SC (2009). Surveillance for highly pathogenic avian influenza in migratory shorebirds at the terminus of the EastAsian-Australasian Fly way. N.-Z. Vet. /., 57 (3), 160-165.

19. Li KS, Xu KM, Peiris JSM, Poon LLM, Yu KZ, Yuen KY, Shortridge KF, Webster RG, Guan Y (2003). Characterization of H9 Subtype Influenza Viruses from the Ducks of Southern China: a Candidate for the Nextlnfluen- za Pandemic in Humans?/. Virology, 77 (12), 6988-6994.

20. Marchenko VY, Alekseev AY, Sharshov KA, Petrov VN, Silko NY, Susloparov IM, Shestopalov AM, Tserennorov D, Otgonbaatar D, Savchenko IA (2012). Avian diseases, 56 (1), 234-237.

21. Oyuntsetseg N, Khasnatinov MA, Molor-Erdene P Oyunbileg J, Liapunov AV, Danchinova GA, Oldokh S, Baigalmaa J, Chimedragchaa C (2014). Evaluation of direct antiviral activity of the Deva-5 herb formulation and extracts of five Asian plants against influenza A virus H3N8. BMC Complement Altem. Med., 14 (235), doi: 10.1186/1472-6882-14-235.

22. Shi Щ Shi Y, Wu Y, Liu D, Gao GF (2 013). Origin and molecular characterization of the human-infecting H6N1 influenza virus in Taiwan. Protein Cell, 4 (11), 846-853.

23. Tong S, Zhu X, Li Y, Shi M, Zhang J, Bourgeois M, Yang H, Chen X, Recuenco S, Gomez J, Chen LM, Johnson A, Tao Y, Dreyfus C, Yu W, McBride R, Carney PJ, Gilbert AT, Chang J, Guo Z, Davis CT, Paulson JC, Stevens J, RupprechtCE, Holmes EC, Wilson IA, Donis RO (2013). New world bats harbor diverse influenza a viruses. CDC PLoS Pathog., 9 (10), ЄІ003657.

24. Tsukamoto K, Ashizawa H, Nakanishi K, Kaji N, Suzuki K, Okamatsu M, Yamaguchi S, Mase M (2008). Subtyping of avian influenza viruses HI to H15 on the basis of hemagglutinin genes by PCR assay and molecular determination of pathogenic potential./ Clin. Microbiol, 46 (9), 3048-3055.