ДЕТЕКЦИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕТЕРМИНАНТ ПАТОГЕННОСТИ У ШТАММОВ KLEBSIELLA SPP., ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ КИШЕЧНОГО БИОТОПА ДЕТЕЙ С ФУНКЦИОНАЛЬНЫМИ ГАСТРОИНТЕСТИНАЛЬНЫМИ РАССТРОЙСТВАМИ

В статье представлена характеристика микробиоты толстой кишки у детей первого года жизни с функциональными гастроинтестинальными расстройствами (ФГИР), а также результаты выявления с помощью молекулярно-генетических методов генетических детерминант у штаммов бактерий рода Klebsiella как у одного из основных представителей микробиоты кишечника у детей. Материалом исследования являлась 61 копрологическая проба. Биологический материал был распределён на две группы сравнения в зависимости от вида выделяемых бактерий при концентрации 105–108 КОЕ/г: 1-я группа – с вегетацией в толстой кишке K. pneumoniae (n = 30); 2-я группа – с вегетацией K. oxytoca (n = 31). Получены данные о количественном и качественном изменении состава микробиоты толстой кишки в группах сравнения. На фоне сниженных показателей бифидо- и лактобактерий для обеих групп характерна высокая степень обсеменённости условно-патогенной микрофлоры – S. aureus, Сlostridium spp. Результаты детекции генетических детерминант патогенности у образцов клебсиелл двух видов – Klebsiella pneumonia и Klebsiella oxytoca – показали, что среди штаммов Klebsiella spp., вегетирующиих в кишечнике детей в качестве составляющей аллохтонной микробиоты, сосредоточен вирулентный потенциал. Детекция генов патогенности у бактерий рода Klebsiella с помощью молекулярно-генетических методов позволит расширить и углубить проблемы поиска структур приспособления и адаптации штаммов бактерий, вызывающих ФГИР у детей первого года жизни.

1. Бухарова Е.В., Долгих В.В., Попкова С.М., Ракова Е.Б., Шабанова Н.М., Немченко У.М., Иванова Е.И., Сердюк Л.В. Патогенный потенциал Klebsiella spp. и Staphylococcus aureus при ассоциативном симбиозе у детей первого года жизни // Успехи современного естествознания. – 2014. – № 12-2. – С. 20–24.

2. Бухарова Е.В., Попкова С.М., Ракова Е.Б., Джиоев Ю.П., Иванова Е.И., Шабанова Н.М., Немченко У.М. Детекция некоторых генетических маркеров факторов патогенности в аутоштаммах Klebsiella spp. у детей первого года жизни // Acta biomedica scientifica. – 2014. – № 2. – С. 58–62.

3. Волгина С.Я., Асанов А.Ю. Галактоземия у детей // Практическая медицина. – 2014. – № 9 (85). – С. 32–41.

4. Леонов В.В., Курлович Н.А., Леонова Л.В., Фатеева Н.М. О возможности влияния микроорганизмов на гомеостаз железа в организме хозяина (обзор литературы) // Acta biomedica scientifica. – 2014. – № 1. – С. 120–124.

5. Поздеев О.К. Молекулярно-генетические основы патогенности энтеробактерий // Практическая медицина. – 2010. – № 2 . – С. 84–88.

6. Рабочий протокол диагностики и лечения функциональных заболеваний органов пищеварения у детей // ГастроNews. – 2010. – С. 3–15.

7. Савилов Е.Д., Мамонтова Л.М., Анганова Е.В., Астафьев В.А. Условно-патогенные микроорганизмы в водных экосистемах Восточной Сибири и их роль в оценке качества вод // Acta biomedica scientifica. – 2008. – № 1. – С. 47–51.

8. Цветаева Н.В., Левина А.А., Мамукова Ю.И. Основы регуляции обмена железа // Клиническая онкогематология. – 2010. – Т. 3, № 3. – С. 278–283.

9. Ikeda M, Mizoguchi M, Oshida Y, Tatsuno K, Saito R, Okazaki M, Okugawa S, Moriya K. (2018). Clinical and microbiological characteristics and occurrence of Klebsiella pneumoniae infection in Japan. Int J Gen Med, 11, 293-299. DOI: 10.2147/IJGM.S166940

10. Ivanova EI, Popkova SM, Dzhioev YuP, Rakova EB, Nemchenko UM, Rychkova LV. (2014). The detection of strains of Escherichia coli producing shiga toxin in populations of normal intestinal microbiota in children with functional disorders of gastrointestinal tract. Klinichescheskaya laboratornaya diagnostika, (11), 56-60.

11. Ivanova EI, Rychkova LV, Nemchenko UM, Bukharova EB, Savelkaeva MV, Dzhioev YuР. (2017). The structure of the intestinal microbiota of the intestine and the frequency of detection of pathogenicity genes (stx1, stx2, bfp) in Escherichia coli with normal enzymatic activity isolated from children during the first year of life. Mol Gen Microbiol Virol, 35 (1), 36-40. DOI: 10.3103/S0891416817110062

12. Kuş H, Arslan U, Türk Dağı H, Fındık D. (2017). Investigation of various virulence factors of Klebsiella pneumoniae strains isolated from nosocomial infections. Mikrobiyol Bul. 51 (4), 329-339. DOI: 10.5578/mb.59716

13. Lam MMC, Wick RR, Wyres KL, Gorrie CL, Judd LM, Jenney AWJ, Brisse S, Holt KE. (2018). Genetic diversity, mobilization and spread of the yersinia bactin-encoding mobile element ICEKp in Klebsiella pneumoniae populations. Microb Genom, 4, 1-14. DOI: 10.1099/mgen.0.000196

14. Lin JC, Koh TH, Lee N, Fung CP, Chang FY, Tsai YK, Ip M, Siu LK. (2014). Genotypes and virulence in serotype K2 Klebsiella pneumoniae from liver abscess and non-infectious carriers in Hong Kong, Singapore and Taiwan. Gut Pathog, 6, 21.

15. Martin RM, Cao J, Wu W, Zhao L, Manthei DM, Pirani A, Snitkin E, Malani PN, Rao K, Bachman MA. (2018). Identification of Pathogenicity-Associated Loci in Klebsiella pneumoniae from Hospitalized Patients. mSystems, 3, e00015-18. DOI: 10.1128/mSystems.00015-18

16. Osman KM, Hassan HM, Orabi A, Abdelhafez AST. (2014). Phenotypic, antimicrobial susceptibility profile and virulence factors of Klebsiella pneumoniae isolated from buffalo and cow mastitic milk. Pathog Glob Health, 108, 191-199. DOI: 10.1179/2047773214Y.0000000141

17. Zhang S, Yang G, Ye Q, Wu Q, Zhang J, Huang Y. (2018). Phenotypic and genotypic characterization of Klebsiella pneumoniae isolated from retail foods in China. Front Microbiol, 9, 289. DOI: 10.3389/fmicb.2018.00289