Аллельный полиморфизм генов «домашнего хозяйства» нетоксигенных штаммов vibrio cholerae, выделенных на территории Сибири и Дальнего Востока
Аннотация
Проведен анализ структуры комплекса генов «домашнего хозяйства» нетоксигенных штаммов Vibrio cholerne. Исследовано 20 изолятов, которые дифференцировались на девять сиквенс-типов, пять из которых -уникальных. Установлена кластеризация по принадлежности к серогруппе: в одну группу вошли все штаммы RO варианта холерного вибриона и один О139 серогруппы, в другую - все штаммы О1 серогруппы. В ряде случаев установлена связь сиквенс-типа с местом и временем выделения штаммов, однако объединение штаммов в наиболее распространенный сиквенс-тип, не зависело от пространственно-временных характеристик.
Об авторах
Э. Г. Гольдапель
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора
Россия
Россия
Л. В. Миронова
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора
Россия
Россия
М. В. Афанасьев
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора
Россия
Россия
С. В. Балахонов
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Россия
Россия
Список литературы
1. Achtman M. et al. Multilocus sequence typing as a replacement for serotyping in Salmonella enterica // PLoS Pathog. - 2012. - Vol. 8. - N 6. - e1002776. doi: 10.1371/ journal.ppat.1002776
2. Bogard R.W., Davies B.W., Mekalanos J.J. MetR-regulated Vibrio cholerae metabolism is required for virulence // MBio. - 2012. - Vol. 3, N 5. - e00236-12. doi: 10.1128/ mBio.00236-12
3. Boonsilp S. et al. A single multilocus sequence typing (MLST) scheme for seven pathogenic Leptospira species // PLoS Negl. Trop. Dis. - 2013. - Vol. 7, N 1. -e1954. doi: 10.1371/journal.pntd.0001954
4. Byun R. et al. Evolutionary relationships of pathogenic clones of Vibrio cholerae by sequence analysis of four housekeeping genes // Infect. Immun. - 1999. - Vol. 67, N 3. - P. 1116-1124.
5. Faruque S.M., Albert M.J., Mekalanos J.J. Epidemiology, genetics, and ecology of toxigenic Vibrio cholera // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 1998. - Vol. 62, N 4. -P. 1301-1314.
6. Larsen M.V. et al. Multilocus sequence typing of total-genome-sequenced bacteria // J. Clin. Microbi ol. - 2012. - Vol. 50, N 4. - Р. 1355-1361. doi: 10.1128/ JCM.06094-11
7. Maiden M.C. et al. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 6. - Р. 3140-3145.
8. Molecular epidemiology of O139 Vibrio cholerae·. mutation, lateral gene transfer, and founder flush / Garg P. [et al.] // Emerg. Infect. Dis. - 2003. - Vol. 9, N 7. - P. 810-814.
9. Moschioni M. et al. Sequence analysis of 96 genomic regions identifies distinct evolutionary lineages within CC156, the largest Streptococcus pneumoniae clonal complex in the MLST database // PLoS One. - 2013. - Vol. 8, N 4. - e61003. doi· 10.1371/journal. pone.0061003.
10. Octavia S. [et al.] Population structure and evolution of non-O1/non-O139 Vibrio cholerae by multilocus sequence typing // PLoS One. - 2013. - Vol. 8, N 6. - e65342. doi· 10.1371/journal.pone.0065342
11. World Health Organization. Cholera. 2012. Fact sheet N 107 [Электронный ресурс]. - Режим доступа· http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs107/ en/index.html.
12. Yeo M. et al. Multilocus sequence typing (MLST) for lineage assignment and high resolution diversity studies in Trypanosoma cruzi// PLoS Negl. Trop. Dis. - 2011. -Vol. 5, N 6. - e1049. doi· 10.1371/journal.pntd.0001049
Рецензия
Для цитирования:
Гольдапель Э.Г., Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Балахонов С.В. Аллельный полиморфизм генов «домашнего хозяйства» нетоксигенных штаммов vibrio cholerae, выделенных на территории Сибири и Дальнего Востока. Acta Biomedica Scientifica. 2013;(6):132-135.
For citation:
Goldapel E.G., Mironova L.V., Afanas'ev M.V., Balakhonov S.V. Allelic polymorphism of atoxigenic Vibrio Cholerae strains of housekeeping genes isolated in Siberia and Far East. Acta Biomedica Scientifica. 2013;(6):132-135. (In Russ.)
Просмотров:
370
Послать статью по эл. почте 
