ПРИМЕНЕНИЕ МАТЕМАТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ ПРЕДСКАЗАНИЯ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ЗАКОНОМЕРНЫХ СВЯЗЕЙ МУТАЦИЙ В БЕЛКАХ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА И ПРОЯВЛЕНИЙ ЕГО ФЕНОТИПИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ
Аннотация
Об авторах
Н. Г. ЗагоруйкоРоссия
Ю. П. Джиоев
Россия
И. В. Козлова
Россия
С. Е. Ткачев
Россия
Ю. С. Букин
Россия
А. И. Парамонов
Россия
А. Ю. Борисенко
Россия
И. А. Борисова
Россия
В. И. Злобин
Россия
О. А. Кутненко
Россия
Список литературы
1. Верхозина М.М., Злобин В.И., Козлова И.В., Беликов С.И. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика региональной популяции вируса клещевого энцефалита Восточной Сибири // Бюлл. ВСНЦ СО РАМН. - 2002. - Т. 2, № 4. - С. 46-49
2. Загоруйко Н.Г. Прикладные методы анализа данных и знаний. - Новосибирск: ИМ СО РАН, 1999. - С. 270
3. Загоруйко Н.Г., Кутненко О.А. Алгоритм GRAD для выбора признаков // Труды Межд. конференции «Применение многомерного статистического анализа в экономике и оценке качества». - М.: Изд-во МЭСИ, 2006. - С. 81-89
4. Загоруйко Н.Г. Интеллектуальный анализ данных, основанный на функции конкурентного сходства // Автометрия. - 2008. - Т. 44, № 3. - C. 31-40
5. Загоруйко Н.Г. Когнитивный анализ данных. - Новосибирск: Академическое издательство ГЕО, 2013. - 186 с
6. Злобин В.И., Мамаев Л.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В. Генетические типы вируса клещевого энцефалита // Журнал инфекционной патологии. - 1996. - Т. 3, № 4. - С. 13-17
7. Урбах В.Ю. Статистический анализ в биологических и медицинских исследованиях. -М.: Медицина, 1975. - 295 с
8. Brault A.C., Huang C.Y., Langevin S.A., Kinney R.M. et al. A single positively selected West Nile viral mutation confers increased virogenesis in American crows // Nat. Genet. - 2007. - Vol. 39 (9). - P. 1162-1166.
9. Demina T.V., Dzhioev Y.P., Verkhozina M.M., Kozlova I.V. et al. Genotyping and characterization of geographical distribution of tick-borne encephalitis virus variants a set of molecular probes // Journal of Medical Virology. - 2010. - Vol. 82, N 6. - P. 965-976.
10. Fauquet C.M., Mayo M.A., Maniloff J., Desselberger U. et al. Virus Taxonomy. - Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. - San Diego, London: Elsevier Academic Press, 2005. - 1162 p.
11. Maier C.C., Delagrave S., Zhang Z.X., Brown N. et al. A single M protein mutation affects the acid inactivation threshold and growth kinetics of a chimeric flavivirus // Virology. - 2007 Jun. - Vol. 362 (2). - P. 468-474.
12. Mandl C.W., Heinz F.X., Stockl E., Kunz C. Genome sequence of tick-borne encephalitis virus (Western subtype) and comparative analysis of nonstructural proteins with other flaviviruses // Virology. - 1989. - Vol. 173 (1). - P. 291-301.
13. Mandl C.W., Holzmann H., Meixner T., Rauscher S. et al. Spontaneous and engineered deletions in the 3’ noncoding region of tick-borne encephalitis virus: construction of highly attenuated mutants of a flavivirus // J. Virol. - 1998. - Vol. 72 (3). - P. 2132-2140.
14. Mandl C.W. Steps of the tick-borne encephalitis virus replication cycle that affect neuropathogenesis // Virus Res. - 2005. - Vol. 111 (2). - P. 161-174.
15. McMinn P.C. The molecular basis of virulence of the encephalitogenic flaviviruses // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78 (Pt. 11). - P. 2711-2722.
16. Wicker J.A., Whiteman M.C., Beasley D.W., Davis C.T. et al. A single amino acid substitution in the central portion of the West Nile virus NS4B protein confers a highly attenuated phenotype in mice / / Virology. - 2006. - Vol. 349 (2). - P. 245-253.
17. Zagoruiko N.G., Borisova I.A., Dyubanov V.V., Kutnenko O.A. Methods of Recognition Based on the Function of Rival Similarity // Pattern Recognition and Image Analysis. - 2008. - Vol. 18, N 1. - Р. 1-6.
Рецензия
Для цитирования:
Загоруйко Н.Г., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Ткачев С.Е., Букин Ю.С., Парамонов А.И., Борисенко А.Ю., Борисова И.А., Злобин В.И., Кутненко О.А. ПРИМЕНЕНИЕ МАТЕМАТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ ПРЕДСКАЗАНИЯ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ЗАКОНОМЕРНЫХ СВЯЗЕЙ МУТАЦИЙ В БЕЛКАХ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА И ПРОЯВЛЕНИЙ ЕГО ФЕНОТИПИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ. Acta Biomedica Scientifica. 2014;(6):89-95.
For citation:
Zagoruyko N.G., Dzhioev Yu.P., Kozlova I.V., Tkachev S.E., Bukin Yu.S., Paramonov A.I., Borisenko A.Yu., Borisova I.A., Zlobin V.I., Kutnenko O.A. APPLICATION OF MATHEMATICAL METHOD PREDICTIONS FOR IDENTIFICATION OF PATTERNS RELATIONS MUTATIONS IN PROTEINS ENCEPHALITIS VIRUS AND A MANIFESTATION OF ITS PHENOTYPIC TRAITS. Acta Biomedica Scientifica. 2014;(6):89-95. (In Russ.)