Preview

Acta Biomedica Scientifica

Advanced search

MLVA-TYPINGIN THE ANALYSIS of THE POPULATION STRUCTURE of VIBRIO CHOLERAE, CIRCULATING IN PRIMORSKY KRAI TERRITORY, DURING EPIDEMIOLOGICAL WELFARE

Abstract

In order to study the population structure of Vibrio cholerae, circulating in the waters of Primorsky Region territory during epidemiological welfare, was carried out a retrospective MLVA-typing of 50 V.cholerae strains isolated since 1976 up to 2011 years. There was revealed non-toxigenic V. cholerae strains heterogeneity, consisting in the variability of structure of these tandem repeat loci. The waters circulation of Primorsky Region territory during epidemiological welfare V.cholerae, submitted by no less than 30 unique genotypes and 8 clusters is represented. There is a high discriminatory power of the MLVA. The Hunter Gaston index of isolates studied is 0.988. In some cases, was revealed relationship between genotype (identical and closely related allelic profiles) with time and place of V.cholerae strains isolation.

About the Authors

Z. Y. Khunkheeva
Irkutsk Antiplague Research Institute of Siberia and Far East
Russian Federation


L. V. Mironova
Irkutsk Antiplague Research Institute of Siberia and Far East
Russian Federation


M. V. Afanasjev
Irkutsk Antiplague Research Institute of Siberia and Far East
Russian Federation


A. S. Ponomareva
Irkutsk Antiplague Research Institute of Siberia and Far East
Russian Federation


L. Y. Urbanovich
Irkutsk Antiplague Research Institute of Siberia and Far East
Russian Federation


T. V. Khomenko
Vladivostok branch of Primorsky Antiplague Station
Russian Federation


A. S. Kim
Primorsky Antiplague Station
Russian Federation


V. P. Borzov
Primorsky Antiplague Station
Russian Federation


A. V. Allenov
Primorsky Antiplague Station
Russian Federation


S. V. Balakhonov
Irkutsk Antiplague Research Institute of Siberia and Far East
Russian Federation


References

1. Балахонов С.В., Миронова Л.В., Урбанович Л.Я. и др. К использованию ПЦР для детекции маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae // Генная диагностика особо опасных инфекций : Материалы 1-й Всероссийской научно-практ. конф. - Саратов, 2000. - С. 23-26.

2. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю. и др. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae // Биотехнология. - 2001. -№ 6. - С. 85-88.

3. Марамович А.С., Урбанович Л.Я., Ганин В.С., Миронова Л.В. и др. Холера в Сибири и на Дальнем Востоке на этапах VII пандемии // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 116-123.

4. Марамович А.С. Научное обоснование системы эпидемиологического надзора за холерой в условиях Сибири и Дальнего Востока : дис.. докт. мед. наук: 14.00.30. - Иркутск, 1983. - 402 с.

5. Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я. и др. Определение геномных маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae, выделенных в Сибири и на Дальнем Востоке // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 132-138.

6. Мурначев Г.П., Марамович А.С., Маслов Д.В., Алленов А.В. Холера в Приморье: Эколого-эпидемиологические аспекты - Владивосток, 2009. - 279 с.

7. Онищенко Г.Г., Марамович А.С., Голубинский Е.П., Урбанович Л.Я. и др. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщение 1. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Владивостоке // Журн. микробиол. - 2000. - № 5. - С. 26-31.

8. Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H., Broza Y.Y. et al. Vibrio cholerae Strain Typing and Phylogeny Study Based on Simple Sequence Repeats // J. Clin. Microbiol. - 2007. -Vol. 45, N 3. - P. 736-746.

9. Ghosh R., Nair G.B., Tang L., Morris J.G. et al. Epidemiological study of Vibrio cholerae using variable number of tandem repeats // FEMS Microbiol Lett. - 2008. -N 288. - P. 196-201.

10. Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity // J. Clin. Microbiol. - 1988. -Vol. 26 (11). - P. 2465-2466.

11. Kendall E.A., Chowdhury F., Begum Y., Khan A.I. et al. Relatedness of Vibrio cholerae 01/0139 isolates from patients and their household contacts, determined by multilocus - variable number tandem repeat analysis // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 17. - P. 4367-4376.

12. Ryan E.T. Haiti in the context of the current global cholera pandemic // Emerging Infectious Diseases. -2011. - Vol. 17, N 11. - P. 2175-2176.

13. Satcher D. Emerging infections: getting ahead of the curve // Emerging Infectious Diseases. - 1995. - Vol. 1, N 1. - P. 1-6

14. Selander R.K., Caugant D.A., Ochman H., Musser J.M. et al. Methods of multilocus enzyme electrophoresis for bacterial population genetics and systematic // Appl. Environ. Microbiol. - 1986. - Vol. 51. - P. 873-884.

15. Weekly epidemiological record. - 2013. - Vol. 88, N 31 - P. 321-336.


Review

For citations:


Khunkheeva Z.Y., Mironova L.V., Afanasjev M.V., Ponomareva A.S., Urbanovich L.Y., Khomenko T.V., Kim A.S., Borzov V.P., Allenov A.V., Balakhonov S.V. MLVA-TYPINGIN THE ANALYSIS of THE POPULATION STRUCTURE of VIBRIO CHOLERAE, CIRCULATING IN PRIMORSKY KRAI TERRITORY, DURING EPIDEMIOLOGICAL WELFARE. Acta Biomedica Scientifica. 2014;(1):84-89. (In Russ.)

Views: 417


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2541-9420 (Print)
ISSN 2587-9596 (Online)