Preview

Acta Biomedica Scientifica

Расширенный поиск

MLVA-ТИПИРОВАНИЕ В АНАЛИЗЕ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИИ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ПРИМОРСКОГО КРАЯ В ПЕРИОД ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО БЛАГОПОЛУЧИЯ

Полный текст:

Аннотация

С целью изучения популяционной структуры штаммов Vibrio cholerae, циркулирующих в водоемах Приморского края в период эпидемиологического благополучия проведено ретроспективное MLVA-типирование 50 культур, изолированных с 1976 по 2011 гг. В результате выявлена гетерогенность нетоксигенных V cholerae, заключающаяся в вариабельности структуры исследуемых локусов тандемных повторов. Показано, что на фоне эпидемиологического благополучия в водоемах Приморского края циркулируют V. cholerae, представленные не менее чем 30 уникальными и 8 кластерными генотипами. Метод MLVA-типирования обладает высокой дискриминирующей способностью в отношении исследуемых изолятов, индекс Хантера-Гастона составляет 0,988. В отдельных случаях выявлена взаимосвязь генотипа (идентичные и близкородственные аллельные профили) со временем и местом выделения штаммов V cholerae.

Об авторах

Ж. Ю. Хунхеева
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Россия


Л. В. Миронова
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Россия


М. В. Афанасьев
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Россия


А. С. Пономарева
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Россия


Л. Я. Урбанович
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Россия


Т. В. Хоменко
ФКУЗ Приморская ПЧС Роспотребнадзора
Россия


А. С. Ким
ФКУЗ Приморская ПЧС Роспотребнадзора
Россия


В. П. Борзов
ФКУЗ Приморская ПЧС Роспотребнадзора
Россия


А. В. Алленов
ФКУЗ Приморская ПЧС Роспотребнадзора
Россия


С. В. Балахонов
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Россия


Список литературы

1. Балахонов С.В., Миронова Л.В., Урбанович Л.Я. и др. К использованию ПЦР для детекции маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae // Генная диагностика особо опасных инфекций : Материалы 1-й Всероссийской научно-практ. конф. - Саратов, 2000. - С. 23-26.

2. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю. и др. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae // Биотехнология. - 2001. -№ 6. - С. 85-88.

3. Марамович А.С., Урбанович Л.Я., Ганин В.С., Миронова Л.В. и др. Холера в Сибири и на Дальнем Востоке на этапах VII пандемии // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 116-123.

4. Марамович А.С. Научное обоснование системы эпидемиологического надзора за холерой в условиях Сибири и Дальнего Востока : дис.. докт. мед. наук: 14.00.30. - Иркутск, 1983. - 402 с.

5. Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я. и др. Определение геномных маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae, выделенных в Сибири и на Дальнем Востоке // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 132-138.

6. Мурначев Г.П., Марамович А.С., Маслов Д.В., Алленов А.В. Холера в Приморье: Эколого-эпидемиологические аспекты - Владивосток, 2009. - 279 с.

7. Онищенко Г.Г., Марамович А.С., Голубинский Е.П., Урбанович Л.Я. и др. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщение 1. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Владивостоке // Журн. микробиол. - 2000. - № 5. - С. 26-31.

8. Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H., Broza Y.Y. et al. Vibrio cholerae Strain Typing and Phylogeny Study Based on Simple Sequence Repeats // J. Clin. Microbiol. - 2007. -Vol. 45, N 3. - P. 736-746.

9. Ghosh R., Nair G.B., Tang L., Morris J.G. et al. Epidemiological study of Vibrio cholerae using variable number of tandem repeats // FEMS Microbiol Lett. - 2008. -N 288. - P. 196-201.

10. Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity // J. Clin. Microbiol. - 1988. -Vol. 26 (11). - P. 2465-2466.

11. Kendall E.A., Chowdhury F., Begum Y., Khan A.I. et al. Relatedness of Vibrio cholerae 01/0139 isolates from patients and their household contacts, determined by multilocus - variable number tandem repeat analysis // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 17. - P. 4367-4376.

12. Ryan E.T. Haiti in the context of the current global cholera pandemic // Emerging Infectious Diseases. -2011. - Vol. 17, N 11. - P. 2175-2176.

13. Satcher D. Emerging infections: getting ahead of the curve // Emerging Infectious Diseases. - 1995. - Vol. 1, N 1. - P. 1-6

14. Selander R.K., Caugant D.A., Ochman H., Musser J.M. et al. Methods of multilocus enzyme electrophoresis for bacterial population genetics and systematic // Appl. Environ. Microbiol. - 1986. - Vol. 51. - P. 873-884.

15. Weekly epidemiological record. - 2013. - Vol. 88, N 31 - P. 321-336.


Для цитирования:


Хунхеева Ж.Ю., Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Пономарева А.С., Урбанович Л.Я., Хоменко Т.В., Ким А.С., Борзов В.П., Алленов А.В., Балахонов С.В. MLVA-ТИПИРОВАНИЕ В АНАЛИЗЕ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИИ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ПРИМОРСКОГО КРАЯ В ПЕРИОД ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО БЛАГОПОЛУЧИЯ. Acta Biomedica Scientifica. 2014;(1):84-89.

For citation:


Khunkheeva Z.Y., Mironova L.V., Afanasjev M.V., Ponomareva A.S., Urbanovich L.Y., Khomenko T.V., Kim A.S., Borzov V.P., Allenov A.V., Balakhonov S.V. MLVA-TYPINGIN THE ANALYSIS of THE POPULATION STRUCTURE of VIBRIO CHOLERAE, CIRCULATING IN PRIMORSKY KRAI TERRITORY, DURING EPIDEMIOLOGICAL WELFARE. Acta Biomedica Scientifica. 2014;(1):84-89. (In Russ.)

Просмотров: 26


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2541-9420 (Print)
ISSN 2587-9596 (Online)