ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ ХАНТАВИРУСА ХОККАЙДО (HOKV), ЦИРКУЛИРУЮЩЕГО СРЕДИ M. RUFOCANUS НА ТЕРРИТОРИИ ПРИБАЙКАЛЬЯ

Хантавирус Хоккайдо (HOKV) впервые был выявлен от красно-серых полевок Myodes rufocanus в Японии. Дальнейшие исследования выявили циркуляцию HOKV в популяциях M. rufocanus на территории Дальнего Востока России, Сахалина, Бурятии и Китая. Ткани от 68 полевок, отловленных в природных биотопах с южной и западной сторон озера Байкал, протестированы на наличие хантавирусного антигена методом ИФА. Ткани антиген-позитивных грызунов анализировали методом ОТ-ПЦР, таксономическая идентификация видов основана на филогенетическом анализе фрагмента последовательности гена цитохрома b. Хантавирусные последовательности Lи S-сегментов генома были выявлены от двух антиген-положительных полевок M. rufocanus из Тункинского района Республики Бурятия (южная сторона) и Ольхонского района Иркутской области (западная сторона). Анализ последовательностей показал, что новые изоляты принадлежат к двум различным генетическим вариантам HOKV Ранее неизвестный генетический вариант, названный Сибирь, был обнаружен у полевки, отловленной в Ольхонском районе. Второй генетический вариант Байкал, выявленный в Тункинском районе был близок к ранее описанному изоляту из того же региона. Показано, что уровни различия нуклеотидных и кодируемых аминокислотных последовательностей двух изолятов составили l8,4 % и 5,3 % для фрагмента L-сегмента и 17,4 % и 3,5 % для фрагмента S-сегмента. Различие последовательностей генома новых изолятов в сравнении с изолятами HOKV из географически удаленных регионов составило 17,4-21,5 и 3,9-6,8 % для фрагмента L-сегмента и 15,2-17,0 и 3,3-4,0 % для фрагмента S-сегмента, соответственно. На филогенетическом дереве, полученном на основе нуклеотидных последовательностей фрагмента L-сегмента генома длиной 346 нуклеотидных остатков, изоляты HOKV из Японии и России формировали четыре ветви. Эти ветви представлены ранее известными ветвями Япония (изоляты Kitahiyama128L/2008, Tobetsu35L/2010 и Sakhalin99L/1998 из Японии и Сахалина) и Шкотово (изолят Khekhtsir37L/2002 с Дальнего Востока России) и новыми ветвями Байкал и Сибирь. При сравнительном анализе N белка изолятов HOKVиз разных географических регионов установлены маркерные аминокислотные остатки: Lys₅, Arg₂₆, Val/Ile₆₈, Val/Ala₉ He₂₆₂, Pro₂₈₃.

hantavirus, Hokkaido, Myodes rufocanus, Russia

1. Данчинова Г.А., Яшина Л.Н., Чапоргина Е.А., Хаснатинов М.А. и др. Хантавирусы на территории Прибайкалья // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2008. № 13. С. 180-181.

2. Малкин А.Е., Мясников Ю.А., Рыльцева Е.В., Ткаченко Е.А. Ландшафтное районирование природных очагов ГЛПС в России // Медицинская паразитол. и паразитар. болезни. 1996. № 2. С. 27-32.

3. Ткаченко Е.А., Рыльцева Е.В., Мясников Ю.А., Иванов А.П. и др. Изучение циркуляции вируса геморрагической лихорадки с почечным синдромом среди мелких млекопитающих на территории СССР // Вопр. вирусол. 1987. № 32 (6). С. 709-715.

4. Яшина Л.Н., Слонова Р.А., Олейник О.В., Кузина И.И. и др. Новый генетический вариант вируса Пуумала в Приморье и его природный носитель, красно-серая полевка Clethrionomys rufocanus // Вопр. вирусол. 2004. № 49 (6). С. 34-37.

5. Brummer-Korvenkontio M., Henttonen H., Va-hery A. Hemorrhagic fever with renal syndrome in Finland: ecology and virology of nephropathia epidemica // Scand. J. Infect. Dis. 1982. Vol. 36. P. 88-91.

6. Dekonenko A., Yakimenko V., Ivanov A., Morozov V. et al. Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin // Infect. Genet. Evol. 2003. Vol. 3. -P. 245-257.

7. Garanina S.B., Platonov A.E., Zhuravlev V.I., Murashkina A.N. et al. Genetic diversity and geographic distribution of hantaviruses in Russia // Zoonoses Public Health. 2009. Vol. 56. P. 297-309.

8. Kariwa H., Yashimatsu K., Sawabe J., Yokota E. et al. Genetic diversities of hantaviruses among rodents in Hokkaido, Japan and Far East Russia // Virus Res. 1999. -Vol. 59. P. 219-228.

9. Kariwa H., Yoshizumi S., Arikawa J., Yoshimatsu K. et al. Evidence for the existence of Puumala-related virus among Clethrionomys rufocanus in Hokkaido, Japan // Am. J. Trop. Med. Hyg. 1995. P. 222-227.

10. Kosoy M., Slonova R., Mills J., Mandel E. et al. Community structure and prevalence of hantavirus infection in rodents: a geographic division of the enzootic area in far eastern Russia // J. Vect. Ecol. 1997. Vol. 22. P. 52-63.

11. Kraus A.A., Kafteri M.J., Giese T., Ulrich R. et al. Differential antiviral response of endothelian cells after infection with pathogenic and nonpathogenic hantaviruses // J. Virol. 2004. Vol. 78. P. 6143-6150.

12. Mills J.N., Childs J.E., Ksiazek T.G., Peters C.J. Methods for trapping and sampling small mammals for virologic testing. U.S. Department of Health and Human Services, Center for Disease Control and Prevention. -Atlanta, 1995.

13. Plyusnin A., Vapalahti A., Ulfves K., Lehvaslaiho H. et al. Sequences of wild Puumala virus genes show a correlation of genetic variation with geographic origin of the strains // J. Gen. Virol. 1994. Vol. 75. P. 405-409.

14. Plyusnina A., Laakkonen J., Niemimaa J., Nemirov K. et al. Genetic analysis of hantaviruses carried by Myodes and Microtus rodents in Buryatia // Virol. J. 2008. Vol. 54. P. 4-10.

15. Sanada T., Seto T., Ozaki Y., Saasa N. et al. Isolation of Hokkaido virus, genus Hantavirus, using a newly established cell line derived from the kidney of the grey red-backed vole (myodes rufocanus bedfordiae) // J. Gen. Virol. 2012. P. 2237-2246.

16. Schmaljohn C., Hjelle B. Hantaviruses: a global disease problem // Emerg. Infect. Dis. 1987. Vol. 3. -P. 95-104.

17. Sironen T., Vaheri A., Plyusnin A. Molecular evolution of Puumala hantavirus // J. Virol. 2001. Vol. 75. P. 11803-11810.

18. Song K.J., Baek L.J., Moon S., Ha S.J. et al. Muju virus, a novel hantavirus harboured by the arvicolid rodent Myodes regulus in Korea // J. Gen. Virol. 2007. -Vol. 88. P. 3121-3129.

19. Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: Molecular evolutionary genetic analysis (MEGA) software version 4.0 // Mol. Biol. Evol. 2007. Vol. 24. -P. 1596-1599.

20. Vapalahti O., Mustonen J., Lundkvist A., Hent-tonen H. et al. Hantavirus infections in Europe // Lancet Infect. Dis. 2003. Vol. 3. P. 653-661.

21. Zhang Y.Z., Zou Y., Yan Y.Z., Hu G.W. et al. Detection of phylogenetically distinct Puumala-like viruses from red-grey vole Clethrionomys rufocanus in China // J. Med. Virol. 2007. Vol. 79. P. 1208-1218.