664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16.
младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.
ul. Timiryazeva 16, Irkutsk 664003.
Junior Research Officer at the Laboratory of Epidemiologically and Socially Important Infections.
690002, г. Владивосток, просп. Острякова, 2.
аспирант кафедры эпидемиологии и военной эпидемиологии.
prosp. Ostryakova 2, Vladivostok 690002.
Postgraduate at the Department of Epidemiology and Military Epidemiology.
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16.
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.
ul. Timiryazeva 16, Irkutsk 664003.
Сandidate of Medical Sciences, Senior Research Officer at the Laboratory of Epidemiologically and Socially Important Infections.
690002, г. Владивосток, просп. Острякова, 2.
доктор медицинских наук, профессор, профессор кафедры эпидемиологии и военной эпидемиологии.
prosp. Ostryakova 2, Vladivostok 690002.
Doctor of Medical Sciences, Professor, Professor of the Department of Epidemiology and Military Epidemiology.
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16.
664049, г. Иркутск, Юбилейный, 100.
октор медицинских наук, научный сотрудник Центральной научно-исследовательской лаборатории; руководитель лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.
ul. Timiryazeva 16, Irkutsk 664003.
Yubileynyi 100, Irkutsk 664049.
Doctor of Medical Sciences, Senior Research Officer at the Central Research Laboratory; Head of the Laboratory of Epidemiologically and Socially Significant Infections.
По данным ВОЗ, треть населения в мире инфицированы микобактериями туберкулёза, в результате чего ежегодно умирает почти 2 миллиона человек. Дальний Восток относится к территориям с высоким уровнем заболеваемости и распространённости туберкулёза. Одним из основных факторов, влияющих на распространённость туберкулёзной инфекции, является развитие МЛУ и ШЛУ. Случаи туберкулёза, связанные с развитием лекарственной устойчивости, как правило, вызваны эпидемическими штаммами МБТ. Важным является исследование распространённости ТБ на территориях с высоким бременем инфекции, к которым и относится Дальний Восток. Целью исследования было провести генотипирование штаммов и оценить частоту распространённости субтипов CC1 и CC2 на территории Приморского края. Материалы и методы. ДНК из 99 клинических изолятов MБT из Приморского края были отгенотипированы с использованием делеционного анализа по RD 105/207, MIRU-VNTR 24 типирования. Результаты. Доминирующее количество штаммов относилось к генотипу Пекин (59,6 %). Экспресс-метод показал 22 изолята подтипа CC2/W148, который имел 6 различных профилей MIRU-VNTR-24. Согласно классификации MLVA MtbC 15-9 наиболее распространённым среди изолятов профиля CC2/W148 является 100-32 (59,1 %). Среди этих профилей была зарегистрирована самая высокая частота МЛУ/ШЛУ – 69,2 %. По результатам экспресс-анализа 46 изолятов с 30 различными профилями MIRU-VNTR-24 принадлежали подтипу CC1, из которых доминирующее число принадлежало 99-32 и 94-32 на долю которых приходилось одинаковое количество профилей – 15,2 %. Выводы. Методы экспресс-генотипирования эпидемических субтипов генотипа Пекин могут иметь большое значение для эпидемиологического надзора и клинической практики. Разработанные методы позволяют определить более широкий диапазон штаммов, чем ранее используемые методы.
Background. The Far East is the territory with high rate of incidence and prevalence of tuberculosis. Cases of tuberculosis caused by epidemic strains have high frequency of MDR and XDR. It is important to study the prevalence of TB in areas with a high burden of infection, to which the Far East belongs. The aim of the research is to carry out genotyping of strains and assess the prevalence of CC1 and CC2 subtypes in the territory of Primorsky Krai. Materials and methods. The DNAs of 99 clinical isolates of MBT from Primorsky Krai have been genotyped by the 24-locus MIRU-VNTR and RD105/RD207. Results. The dominant number of strains pertained to Beijing genotype (59.6 %). The express method revealed 22 isolates of the CC2/W148 subtype, which had 6 different MIRU-VNTR-24 profile. According to MLVA classification MtbC 15-9, the most common among the isolates of CC2/W148 profile is 100-32 (59.1 %). Among these profiles the highest frequency of MDR/XDR was recorded – 69,2 %. According to the results of the express analysis, 39 isolates with 26 different MIRU-VNTR-24 profiles belonged to the CC1 subtype, of which the dominant number belonged to 99-32 and 94-32. Conclusions. The methods of express genotyping of epidemic subtypes of the Beijing genotype are very important for epidemiological surveillance and clinical practice. The developed methods allow to define a wider range of strains than previously used methods.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.