664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1.
аспирант, ассистент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии.
ul. Krasnogo Vosstaniya 1, Irkutsk 664003.
Postgraduate, Teaching Assistant at the Department of Microbiology, Virology and Immunology.
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1.
кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, заведующий лабораторией молекулярной вирусологии и биотехнологии НИИ биомедицинских технологий.
ul. Krasnogo Vosstaniya 1, Irkutsk 664003.
Candidate of Biological Sciences, Leading Research Officer, Head of the Laboratory of Molecular Virology and Biotechnology, Research Institute of Biomedical Technologies.
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1.
аспирант кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии.
ul. Krasnogo Vosstaniya 1, Irkutsk 664003.
Postgraduate at the Department of Microbiology, Virology and Immunology.
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1.
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии и биотехнологии НИИ биомедицинских технологий.
ul. Krasnogo Vosstaniya 1, Irkutsk 664003.
Candidate of Medical Sciences, Senior Research Officer at the Laboratory of Molecular Virology and Biotechnology, Research Institute of Biomedical Technologies.
664003, г. Иркутск, ул. Карла Маркса, 1.
студентка 3-го курса кафедры физико-химической биологии биолого-почвенного факультета.
ul. Karla Marksa 1, Irkutsk 664003.
3rd year student at the Department of Physicochemical Biology of the Faculty of Biology and Soil Science.
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1.
ассистент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии.
ul. Krasnogo Vosstaniya 1, Irkutsk 664003.
Candidate of Medical Sciences, Senior Lecturer at the Department of Microbiology, Virology and Immunology.
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1.
кандидат медицинских наук, старший преподаватель кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии.
ul. Krasnogo Vosstaniya 1, Irkutsk 664003.
Teaching Assistant at the Department of Microbiology, Virology and Immunology.
664003, г. Иркутск, ул. Карла Маркса, 1.
студентка 3-го курса кафедры физико-химической биологии биолого-почвенногофакультета.
ul. Karla Marksa 1, Irkutsk 664003.
3rd year student at the Department of Physiochemical Biology of the Faculty of Biology and Soil Science.
Pretoria 0002, Private Bag X20, Hatfield, 0028, South Africa.
кандидат биологических наук, доцент Центра биоинформатики и компьютерной биологии, кафедра биохимии, генетики и микробиологии.
Pretoria 0002, Private Bag X20, Hatfield, 0028.
PhD in Biology, Associate Professor.
Harbin 157, Baojian Rd, Nangang Qu, Haerbin Shi, Heilongjiang Sheng.
аспирант кафедры микробиологии.
Harbin 157, Baojian Rd, Nangang Qu, Haerbin Shi, Heilongjiang Sheng.
Postgraduate at the Department of Microbiology, School of Public Health.
Harbin 157, Baojian Rd, Nangang Qu, Haerbin Shi, Heilongjiang Sheng.
профессор, заведующийкафедрой микробиологии.
Harbin 157, Baojian Rd, Nangang Qu, Haerbin Shi, Heilongjiang Sheng.
Professor, Director of the Department of Microbiology.
664003, г. Иркутск, ул. Красного Восстания, 1.
доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, заведующий кафедрой микробиологии, вирусологии и иммунологии, директор НИИ биомедицинских технологий.
ul. Krasnogo Vosstaniya 1, Irkutsk 664003.
Doctor of Medical Sciences, Professor, Academician of RAS, Head of the Department of Microbiology, Virology and Immunology, Director of the Research Institute of Biomedical Technologies.
Устойчивость к медицинским препаратам среди важных бактериальных патогенов признаётся одной из основных угроз для общественного здравоохранения. Увеличение количества резистентных инфекции остаётся серьёзной проблемой современного здравоохранения. Самыми распространёнными микроорганизмами являются устойчивые к пенициллину Streptococcus pneumoniae, устойчивые к ванкомицину энтерококки и метициллин- и ванкомицин-резистентные штаммы Staphylococcus aureus. Эти резистентности в условнопатогенных бактериях сделали невозможной антимикробную терапию многих инфекций. По этим причинам учёным необходимо разрабатывать новые способы лечения бактериальных инфекций. В выполненной научной работе демонстрируется совершенно новый способ для оценки устойчивости золотистого стафилококка к бактериофагам при помощи биоинформационного алгоритма из поисковых биоинформационных программ. В результате удалось обнаружить и представить гены CRISPR-системы и две CRISPR-кассеты, состоящие из спейсеров, разделённых повторами. В выполненной работе удалось не только обнаружить, но и выяснить тип CRISPR/Cas-системы штамма S. aureus (тип IIIA). Обнаруженные последовательности спейсеров в CRISPR-кассетах оказались идентичны протоспейсерам бактериофагов рода Staphylococcus, Mycobacterium, Streptococcus, Bacillus, Gordonia, Arthrobacter, Streptomyces. Алгоритм программных методов поиска локусов CRISPR/Cas-систем может быть применён на многих других расшифрованных бактериальных геномах с целью возврата бактериофаговой терапии.
The emergence of resistance among the most important bacterial pathogens is generally recognized as one of the major public health problems. The most important of these organisms are penicillin-resistant Streptococcus pneumoniae, vancomycin-resistant enterococci and methicillin- and vancomycin-resistant Staphylococcus aureus. These antibiotic resistance in common pathogens have made antimicrobial therapy of many infections. Scientists need to look for new ways of treating bacterial infections in the work, using the developed algorithm from the methods of search software in the genomic structure of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228, the CRISPR/Cas locus and the division structures of its CRISPR cassette. The results of the bacteriophage search through the decoded spacer sequences of CRISPR-cassettes of this strain were also obtained using the developed algorithm of the software methods of bioinformatics. It was determined that the CRISPR/Cas system of strain of ST228 of S. aureus was of type IIIA. It is shown that cas-genes are in the immediate vicinity of CRISPR cassettes. The spacer structures in the detected CRISPR cassette are the Staphylococcus, Mycobacterium, Streptococcus, Bacillus, Gordonia, Arthrobacter, Streptomyces. The implementation of the algorithm of program methods for locating CRISPR/Cas-loci can be applied to many other decoded bacterial genomes to return bacteriophage therapy.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.