Карташов Михаил Юрьевич – кандидат биологических наук, заведующий сектором молекулярной диагностики,
630559, Новосибирская обл., п. Кольцово
Mikhail Yu. Kartashov – Cand. Sc. (Biol.), Head of the Sector for Molecular Diagnostics,
Koltsovo, Novosibirsk region 630559
Ханхареев Сергей Степанович – кандидат медицинских наук, руководитель,
670013, г. Улан-Удэ, ул. Ключевская, 45Б
Sergey S. Khankhareev – Cand. Sc. (Med.), Director,
Klyuchevkaya str. 45B, Ulan-Ude 670013
Кривошеина Екатерина Ильинична – научный сотрудник отдела молекулярной вирусологии флавивирусов,
630559, Новосибирская обл., п. Кольцово
Ekaterina I. Krivosheina – Research Officer at the Department Molecular Virology of Flavaviruses,
Koltsovo, Novosibirsk region 630559
Свирин Кирилл Андреевич – младший научный сотрудник отдела молекулярной вирусологии флавивирусов,
630559, Новосибирская обл., п. Кольцово
Kirill A. Svirin – Junior Research Officer at the Department Molecular Virology of Flavaviruses,
Koltsovo, Novosibirsk region 630559
Курушина Валентина Юрьевна – стажёр-исследователь отдела молекулярной вирусологии флавивирусов,
630559, Новосибирская обл., п. Кольцово
Valentina Yu. Kurushina – Research Assistant at the Department Molecular Virology of Flavaviruses,
Koltsovo, Novosibirsk region 630559
Терновой Владимир Александрович – кандидат биологических наук, врио заведующего отделом молекулярной вирусологии флавивирусов,
630559, Новосибирская обл., п. Кольцово
Vladimir A. Ternovoi – Cand. Sc. (Biol.), Acting Head of the Department Molecular Virology of Flavaviruses,
Koltsovo, Novosibirsk region 630559
Неблагополучная эпидемиологическая ситуация с трансмиссивными инфекциями, переносимыми клещами, может характеризоваться не только ростом встречаемости уже известных заболеваний, но и выявлением новых нозологических форм и возбудителей, роль которых пока остаётся малоизученной. Примером таких возбудителей является вирус Янггоу (YGTV, Yanggou tick virus), относящийся к группе сегментированных флавиподобных вирусов.
Цель исследования. Поиск и молекулярно-генетическая характеристика генетических вариантов YGTV, обнаруженных в клещах Dermacentor nuttalli Ol. (1929) на территории Республики Бурятия.
Материалы и методы. В исследовании проанализировано 350 индивидуальных образцов имаго клещей вида D. nuttalli, собранных в весенне-летний период 2023 г. на территории пяти районов Республики Бурятия. Выявление РНК YGTV выполняли с помощью метода полимеразной цепной реакции с последующим определением нуклеотидной последовательности и проведением филогенетического анализа для каждого из 4 сегментов генома.
Результаты. В пробе клеща D. nuttalli, отловленного на территории Иволгинского района Республики Бурятия, была обнаружена РНК YGTV, что в дальнейшем было подтверждено секвенированием полученного фрагмента генома. Встречаемость РНК YGTV среди исследуемых клещей D. nuttalli в Бурятии составила 0,3 % (95%-й доверительный интервал: 0,1–1,6). Были разработаны праймеры, позволяющие получить фрагменты всех четырёх сегментов генома YGTV. Выявленный генетический вариант YGTV при проведении филогенетического анализа по всем четырём сегментам отчётливо группируется с последовательностями YGTV, обнаруженными ранее в Китае и России (Республика Горный Алтай и Тыва). Наибольшую степень идентичности выявленный вариант показывает с прототипом Erzin14-T20074.
Заключение. В исследовании впервые показано наличие YGTV на территории Республики Бурятия, что актуализирует необходимость мониторинга циркуляции этого вируса в природных очагах инфекций, переносимых клещами на этой территории, а также дальнейшего уточнения границ распространения флавиподобных вирусов, потенциально опасных для человека.
The unfavorable epidemiological situation with tick-borne vector-borne infections may be characterized not only by an increase in the occurrence of already known diseases, but also by the identification of new infections and pathogens, the role of which remains poorly understood. An example of such pathogens is Yanggou tick virus (YGTV), which belongs to the group of segmented flavi-like viruses.
The aim. To detect and molecular genetic characterization of YGTV found in Dermacentor nuttalli Ol. (1929) ticks on the territory of the Republic of Buryatia.
Materials and methods. The study analyzed 350 individual samples of adult ticks of D. nuttalli species collected in the spring-summer period of 2023 on the territory of five districts of the Republic of Buryatia. The detection of YGTV RNA was performed by PCR followed by nucleotide sequence determination and phylogenetic analysis for each of the 4 genome segments.
Results. In one sample of the tick D. nuttalli, collected in the Ivolginsky district of the Republic of Buryatia, YGTV RNA was detected, which was further confirmed by sequencing of the obtained genome fragment. The incidence of YGTV RNA among the studied D. nuttalli ticks in Buryatia was 0.3 % (95 % CI: 0.1–1.6). Primers were designed to obtain fragments of all four segments of the YGTV genome. The identified genetic variant of YGTV, when analyzed phylogenetically across all four segments, clearly clusters with YGTV sequences found earlier in China and Russia (the Republic of Altai and Tyva). The detected variant shows the highest sequence identity with the prototype strain Erzin14-T20074.
Conclusion. The study shows for the first time the presence of YGTV in the territory of the Republic of Buryatia, which actualizes the need to monitor the circulation of this virus in natural foci of tick-borne infections in this territory, as well as to further clarify the boundaries of the spread of flavi-like viruses potentially dangerous for humans.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.