Жданова Светлана Николаевна – доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник Института эпидемиологии и микробиологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16
Svetlana N. Zhdanova – Dr. Sc. (Med.), Leader Research Officer at the Laboratory of Epidemiologically and Socially Significant Infections, Institute of Epidemiology and Microbiology
Timiryazeva str. 16, Irkutsk 664003
Кондратов Илья Геннадьевич – кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально-значимых инфекций Института эпидемиологии и микробиологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16
Ilya G. Kondratov – Cand. Sc. (Biol.), Research Officer at the Laboratory of Epidemiologically and Socially Significant Infections, Institute of Epidemiology and Microbiology
Timiryazeva str. 16, Irkutsk 664003
Огарков Олег Борисович – доктор медицинских наук, директор Института эпидемиологии и микробиологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16
Oleg B. Ogarkov – Dr. Sc. (Med.), Director of the Institute of Epidemiology and Microbiology
Timiryazeva str. 16, Irkutsk 664003
Актуальность. Иркутская область сохраняет высокие уровни заболеваемости туберкулёзом (ТБ) с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). Обнаружение ассоциированных с МЛУ штаммов Mycobacterium tuberculosis в Иркутской области требует динамической оценки популяции возбудителя ТБ с учётом появления нового резистентного варианта Beijing Central Asian Outbreak (САО).
Цель исследования. Оценить изменения генотипической структуры штаммов M. tuberculosis, циркулирующих в Иркутской области за десятилетний период.
Материалы и методы. Изучено 732 штамма (196 штаммов – 2021–2022 гг., 536 штаммов – 2011–2015 гг.) методами MIRU-VNTR и SNP-типирования.
Результаты. Выявлено повышение уровня МЛУ до 67,4 % с ростом доли пре-широкой лекарственной устойчивости (пре-ШЛУ) (33,2 %) (р < 0,001). В современной выборке возросло доминирование генотипа Beijing (83,7 %) за счёт повышения долей субтипов B0/W148 (38,8 %) и САО (12,8 %) при стабильном общем уровне Central Asian Russian (36,8 %) и других штаммов Beijing (8,2 %). Отличные от генотипа Beijing штаммы принадлежали в основном к Евро-Американской линии (Lineage 4): LAM (8,9 %), Ural (2,7 %), Haarlem (2,0 %), S (0,5 %) и L4-unclassified (5,3 %); 25 изолятов не классифицированы. В выборке 2011–2015 гг. LAM встречался чаще, чем в современной коллекции (10,8 % против 3,6 %; p < 0,01). Рост МЛУ и пре-ШЛУ статистически значимо проявился среди штаммов Beijing B0/W148 (93,4 % против 66,1 %; р < 0,001).
Заключение. Выявлены неблагоприятные тенденции значительного распространения МЛУ и пре-ШЛУ штаммов генотипа Beijing. Среди штаммов Beijing наиболее успешны не только B0/W148, но и ранее редко встречавшийся в Сибири субтип Beijing CAO; они имеют наибольшие уровни МЛУ и пре-ШЛУ и тенденцию к широкому распространению во всех группах больных ТБ.
Background. Irkutsk region maintains a high incidence rate of multidrug-resistant (MDR) tuberculosis (TB). Detection of MDR-associated Mycobacterium tuberculosis strains in Irkutsk region requires dynamic assessment of the TB pathogen population, taking into account the emergence of a new resistant variant of Beijing Central Asian Outbreak (CAO).
The aim of the study. To assess changes in the genotypic structure of M. tuberculosis strains circulating in the Irkutsk region over a ten-year period.
Materials and methods. A total of 732 M. tuberculosis strains (196 strains for 2021– 2022, 536 strains for 2011–2015) were studied using MIRU-VNTR and SNP typing.
Results. The MDR level increased to 67.4 % with an increase of pre-extensive drug resistance (pre-XDR) (33.2 %) (p < 0.001). In the modern sample, the dominance of the Beijing genotype increased (83.7 %) due to an increase in the proportions of the B0/W148 (38.8 %) and CAO (12.8 %) subtypes with a stable overall level of Central Asian Russian (36.8 %) and other Beijing strains (8.2 %). Strains other than the Beijing genotype belonged mainly to the Euro-American lineage (Lineage 4): LAM (8.9 %), Ural (2.7 %), Haarlem (2.0 %), S (0.5 %) and L4-unclassified (5.3 %); 25 isolates were not classified. In the 2011–2015 sample, LAM was more common than in the modern sample (10.8 % vs. 3.6 %; p < 0.01). The increase in MDR and preXDR was statistically significant among Beijing B0/W148 strains (93.4 % vs. 66.1 %; p < 0.001).
Conclusion. Unfavorable trends of significant spread of MDR and pre-XDR of the Beijing genotype strains were revealed. Among the Beijing strains, not only B0/W148 but also the Beijing CAO subtype, which was previously rare in Siberia, are the most successful; they have the highest levels of MDR and pre-XDR and a tendency to widespread distribution in all groups of TB patients.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.