actabiomedicaActa Biomedica ScientificaActa Biomedica Scientifica2541-94202587-9596Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems10.12737/article_59e85b75b4a0e9.62539831actabiomedica-453Research ArticleЭПИДЕМИОЛОГИЯEPIDEMIOLOGYФилогеография Mycobacterium tuberculosis в центральной и пограничной МонголииPhylogeorgaphy of Mycobacterium tuberculosis in central and border MongoliaОрловаЕ. А.OrlovaE. A.tetraheadral@gmail.comБадлееваМ. В.BadleevaM. V.mbadleeva@mail.ruБаасансурэнЭ. ..BaasansurenE. ..baaska_5047@yahoo.co.ukЭрдэнэгэрэлН. ..ErdenegerelN. ..eegiinar@yahoo.comОюунтуяаТ. ..OyuuntuyaaT. ..toyuntuya_4@yahoo.comБуянхишигБ. ..BuyankhishigB. ..bb_buyankhishig@yahoo.comПунцагБ. ..PuntsagB. ..puntsag55@yahoo.comНямхууД. ..NyamkhuuD. ..dnyamkhuu@nccd.gov.mnЖдановаС. Н.ZhdanovaS. N.svetnii@mail.ruФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»РоссияScientific Centre for Family Health and Human Reproduction ProblemsRussian FederationФГБОУ ВО «Бурятский государственный университет»РоссияBuryat State UniversityRussian FederationНациональный центр инфекционных болезнейРоссияNational Center for Communicable DiseasesRussian Federation20172809201725(1)180185Copyright © Орлова Е.А., Бадлеева М.В., Баасансурэн Э..., Эрдэнэгэрэл Н..., Оюунтуяа Т..., Буянхишиг Б..., Пунцаг Б..., Нямхуу Д..., Жданова С.Н., 20172017Орлова Е.А., Бадлеева М.В., Баасансурэн Э..., Эрдэнэгэрэл Н..., Оюунтуяа Т..., Буянхишиг Б..., Пунцаг Б..., Нямхуу Д..., Жданова С.Н.Orlova E.A., Badleeva M.V., Baasansuren E..., Erdenegerel N..., Oyuuntuyaa T..., Buyankhishig B..., Puntsag B..., Nyamkhuu D..., Zhdanova S.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/453

Всемирное распространение Mycobacterium tuberculosis и масштабы заболеваемости туберкулёзом обусловливают важность эпидемиологических исследований возбудителя: бактериологических, физиологических, генетических, - и, кроме того, особенностей пространственной структуры групп микроорганизмов, отличающихся по патогенетическому потенциалу и филогенетическим дистанциям. Данная работа посвящена изучению филогеографии эпидемически значимых генетических групп M. tuberculosis, циркулирующих в Монголии - регионе с высокой заболеваемостью туберкулёзом. По результатам исследования 309 штаммов возбудителя методами MIRU-VNTR типирования, LSP-типирования и субтитрования (сравнение результатов с референсными MIRU-VNTR профилями, выявление специфичных SNPs) в качестве доминирующего идентифицирован генотип Beijing (субтип CC4). Для данного генотипа характерна высокая частота кластеризации, что свидетельствует как о его эпидемической опасности, так и об относительно недавнем заносе «успешных» штаммов на территорию Монголии. Выявлена также достаточно однородная структура распределения генотипов и субтипов возбудителя в пределах изучаемого региона, которая отличается от структуры российской популяции M. tuberculosis своим субтипическим составом. Таким образом, в качестве возможного источника распространения штаммов субтипа CC4 генотипа Beijing на территорию Монголии предполагаются соседние Восточно-Азиатские регионы, наиболее вероятно - северные провинции Китая (Внутренняя Монголия) или ближайшие страны Юго-Восточной Азии.

The distribution of Mycobacterium tuberculosis and scope of tuberculosis morbidity in the world are extremely considerable. Among regions with high burden of tuberculosis (according to the World Health Organization data for 2015) Mongolia is one of the most disadvantaged countries. This research was continuation of studying of phylogenetic structure of M. tuberculosis for the determination of evolutionary and migration processes in pathogen's northeastern population and was devoted to the study of the spatial distribution of epidemically significant genotypes and subtypes, circulating in central and border (northern and southern) Mongolia. The DNAs of 309 clinical isolates of the pathogen were genotyped by the 24-locus MIRU-VNTR and LSP methods. Strains of the Beijing lineage were additionally analyzed for the presence of specific SNPs and its 24-MIRU-VNTR profiles were compared with reference database of M. Merker et al. (2015). The study indicated significant predominance of strains of the Beijing lineage (subtype CC4). This genotype is characterized by high frequency of clustering, which indicates its epidemic danger and the relatively recent introduction of «successful» strains into the territory of Mongolia. Also, a relatively homogeneous distribution structure of genotypes and subtypes of the pathogen was revealed within the studied region, which differs from the structure of the Russian population of M. tuberculosis by its subtypical composition. Thus, we assuming that CC4-strains of the Beijing lineage spread into Mongolia from neighboring East Asian regions, most likely from the Northern provinces of China (Inner Mongolia) or nearest neighboring countries of Southeast Asia.

генотип Beijingфилогеографиягенетическое разнообразиетуберкулёз в МонголииMycobacterium tuberculosisMIRU-VNTRMycobacterium tuberculosisMIRU-VNTRBeijing lineagephylogeographygenetic diversitytuberculosis in MongoliaReferencesСавилов Е.Д., Синьков В.В., Огарков О.Б. Эпидемиология туберкулёза на Евро-Азиатском континенте: оценка глобального движения штаммов генотипа «Пекин». - Иркутск: РИО ГБОУ ДПО ИГМАПО, 2013. - 120 сСавилов Е.Д., Синьков В.В., Огарков О.Б. Эпидемиология туберкулёза на Евро-Азиатском континенте: оценка глобального движения штаммов генотипа «Пекин». - Иркутск: РИО ГБОУ ДПО ИГМАПО, 2013. - 120 сAnh D.D., Borgdorff M.W., Van L.N., Lan N.T., van Gorkom T., Kremer K., van Soolingen D. (2000). Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype emerging in Vietnam. Emerg Infect Dis, 6 (3), 302-305. doi: 10.3201/eid0603.000312Anh D.D., Borgdorff M.W., Van L.N., Lan N.T., van Gorkom T., Kremer K., van Soolingen D. (2000). Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype emerging in Vietnam. Emerg Infect Dis, 6 (3), 302-305. doi: 10.3201/eid0603.000312Chan M.Y., Borgdorff M., Yip C.W., de Haas P.E., Wong W.S., Kam K.M., van Soolingen D. (2001). Seventy percent of the Mycobacterium tuberculosis isolates in Hong Kong represent the Beijing genotype. Epidemiol Infect, 127 (1), 169-171.Chan M.Y., Borgdorff M., Yip C.W., de Haas P.E., Wong W.S., Kam K.M., van Soolingen D. (2001). Seventy percent of the Mycobacterium tuberculosis isolates in Hong Kong represent the Beijing genotype. Epidemiol Infect, 127 (1), 169-171.Gurjav U., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Ochirbat B., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. (2015). Spatiotemporal evidence for cross-border spread of MDR-TB along the Trans-Siberian Railway line. Int J Tuberc Lung Dis, 19 (11), 1376-1382. doi: 10.5588/ijtld.15.0361.Gurjav U., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Ochirbat B., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. (2015). Spatiotemporal evidence for cross-border spread of MDR-TB along the Trans-Siberian Railway line. Int J Tuberc Lung Dis, 19 (11), 1376-1382. doi: 10.5588/ijtld.15.0361.Gurjav U., Erkhembayar B., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. (2016). Transmission of multi-drug resistant tuberculosis in Mongolia is driven by Beijing strains of Mycobacterium tuberculosis resistant to all first-line drugs. Tuberculosis, 101, 49-53. doi: 10.1016/j.tube.2016.07.010.Gurjav U., Erkhembayar B., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. (2016). Transmission of multi-drug resistant tuberculosis in Mongolia is driven by Beijing strains of Mycobacterium tuberculosis resistant to all first-line drugs. Tuberculosis, 101, 49-53. doi: 10.1016/j.tube.2016.07.010.Hunter P.R., Gaston M.A. (1988). Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity. J Clin Microbiol, 26 (11), 2465-2466.Hunter P.R., Gaston M.A. (1988). Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity. J Clin Microbiol, 26 (11), 2465-2466.Institut Pasteur de la Guadeloupe. (2011). SITVIT-WEB database. Available at: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_0NLINE.Institut Pasteur de la Guadeloupe. (2011). SITVIT-WEB database. Available at: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_0NLINE.Merker M., Blin C., Mona S., Duforet-Frebourg N., Lecher S., Willery E., Blum M., Rüsch-Gerdes S., Mokrousov I., Aleksic E., Allix-Béguec C., Antierens A., Augustynowicz-Kopeć E., Ballif M., Barletta F., Beck H.P., Barry C.E. 3rd, Bonnet M., Borroni E., Campos-Herrero I., Cirillo D., Cox H., Crowe S., Crudu V., Diel R., Drobniewski F., Fauville-Dufaux M., Gagneux S., Ghebremichael S., Hanekom M., Hoffner S., Jiao W.W., Kalon S., Kohl T.A., Kontsevaya I., Lillebæk T., Maeda S., Nikolayevskyy V., Rasmussen M., Rastogi N., Samper S., Sanchez-Padilla E., Savic B., Shamputa I.S., Shen A., Sng L.H., Stakenas P., Toit K., Varaine F., Vukovic D., Wahl C., Warren R., Supply P., Niemann S., Wirth T. (2015). Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nat Genet, 47 (3), 242-249. doi: 10.1038/ng.3195.Merker M., Blin C., Mona S., Duforet-Frebourg N., Lecher S., Willery E., Blum M., Rüsch-Gerdes S., Mokrousov I., Aleksic E., Allix-Béguec C., Antierens A., Augustynowicz-Kopeć E., Ballif M., Barletta F., Beck H.P., Barry C.E. 3rd, Bonnet M., Borroni E., Campos-Herrero I., Cirillo D., Cox H., Crowe S., Crudu V., Diel R., Drobniewski F., Fauville-Dufaux M., Gagneux S., Ghebremichael S., Hanekom M., Hoffner S., Jiao W.W., Kalon S., Kohl T.A., Kontsevaya I., Lillebæk T., Maeda S., Nikolayevskyy V., Rasmussen M., Rastogi N., Samper S., Sanchez-Padilla E., Savic B., Shamputa I.S., Shen A., Sng L.H., Stakenas P., Toit K., Varaine F., Vukovic D., Wahl C., Warren R., Supply P., Niemann S., Wirth T. (2015). Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nat Genet, 47 (3), 242-249. doi: 10.1038/ng.3195.Reed M.B., Pichler V.K., McIntosh F., Mattia A., Fallow A., Masala S., Domenech P., Zwerling A., Thibert L., Menzies D., Schwartzman K., Behr M.A. (2009). Major Mycobacterium tuberculosis lineages associate with patient country of origin. J Clin Microbiol, 47 (4), 1119-1128. doi: 10.1128/JCM.02142-08.Reed M.B., Pichler V.K., McIntosh F., Mattia A., Fallow A., Masala S., Domenech P., Zwerling A., Thibert L., Menzies D., Schwartzman K., Behr M.A. (2009). Major Mycobacterium tuberculosis lineages associate with patient country of origin. J Clin Microbiol, 47 (4), 1119-1128. doi: 10.1128/JCM.02142-08.Supply P. (2005). Multilocus variable number tandem repeat genotyping of Mycobacterium tuberculosis. 73 p. Available at: http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/files/MIRU-VNTRtypingmanualv6.pdf.Supply P. (2005). Multilocus variable number tandem repeat genotyping of Mycobacterium tuberculosis. 73 p. Available at: http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/files/MIRU-VNTRtypingmanualv6.pdf.Van Soolingen D., Qian L., de Haas P.E., Douglas J.T., Traore H., Portaels F., Qing H.Z., Enkhsaikan D., Nymadawa P., van J.D. (1995). Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in countries of East Asia. J Clin Microbiol, 33, 3234-3238.Van Soolingen D., Qian L., de Haas P.E., Douglas J.T., Traore H., Portaels F., Qing H.Z., Enkhsaikan D., Nymadawa P., van J.D. (1995). Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in countries of East Asia. J Clin Microbiol, 33, 3234-3238.World Health Organization. (2016). Global Tuberculosis Report. 201 p.World Health Organization. (2016). Global Tuberculosis Report. 201 p.Yu Q., Su Y., Lu B., Ma Y., Zhao X., Yang X., Dong H., Liu Y., Lian L., Wan L., Wu Y., Wan K. (2013). Genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis isolates from Inner Mongolia, China. PLoS One, 8 (5), 8 p. doi: 10.1371/journal.pone.0057660.Yu Q., Su Y., Lu B., Ma Y., Zhao X., Yang X., Dong H., Liu Y., Lian L., Wan L., Wu Y., Wan K. (2013). Genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis isolates from Inner Mongolia, China. PLoS One, 8 (5), 8 p. doi: 10.1371/journal.pone.0057660.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.