<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">actabiomedica</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Acta Biomedica Scientifica</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Acta Biomedica Scientifica</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2541-9420</issn><issn pub-type="epub">2587-9596</issn><publisher><publisher-name>Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.12737/article_59e859d55cf612.51311447</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">actabiomedica-447</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ФТИЗИАТРИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>PHTHISIOLOGY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Сегментация микроскопических изображений мокроты, окрашенной по методу Циля - Нильсена, с использованием вейвлет-преобразования Mexican Hat</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Segmentation of microscopic images of sputum stained by Ziehl - Nielsen using wavelet transform Mexican Hat</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Наркевич</surname><given-names>А. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Narkevich</surname><given-names>A. N.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">narkevichart@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Виноградов</surname><given-names>К. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vinogradov</surname><given-names>K. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">vinogradov16@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Корецкая</surname><given-names>Н. М.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Koretskaya</surname><given-names>N. M.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">kras-kaftuber@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Соболева</surname><given-names>В. О.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Soboleva</surname><given-names>V. O.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">victory.kay95@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБОУ ВО «Красноярский государственный медицинский университет им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого» Минздрава России</institution></aff><aff xml:lang="en"><institution>Krasnoyarsk State Medical University</institution></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2017</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>28</day><month>09</month><year>2017</year></pub-date><volume>2</volume><issue>5(1)</issue><fpage>141</fpage><lpage>146</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Наркевич А.Н., Виноградов К.А., Корецкая Н.М., Соболева В.О., 2017</copyright-statement><copyright-year>2017</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Наркевич А.Н., Виноградов К.А., Корецкая Н.М., Соболева В.О.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Narkevich A.N., Vinogradov K.A., Koretskaya N.M., Soboleva V.O.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/447">https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/447</self-uri><abstract><p>Обоснование. Микроскопические исследования применяются в диагностике большого числа заболеваний, в том числе туберкулёза лёгких. Бактериоскопическое исследование является практически единственным доступным для общей лечебной сети методом выявления больных туберкулёзом бактериовыделителей. При этом качество бактериоскопической диагностики туберкулёза в клинико-диагностических лабораториях общей лечебной сети остаётся не на должном уровне, что может быть исправлено применением автоматизированного анализа цифровых микроскопических изображений препаратов мокроты, окрашенной по методу Циля - Нильсена. Одним из первых этапов автоматизированного анализа изображений является их сегментация. Целью исследования является изучение возможности сегментации цифрового изображения микроскопического препарата мокроты, окрашенной по методу Циля - Нильсена, с использованием вейвлет-преобразования Mexican Hat. Материалы и методы. В качестве материала исследования использовались 830 цифровых изображений, полученных при микроскопии 10 мазков мокроты, окрашенной по методу Циля - Нильсена. Мазки изготавливались из мокроты пациентов, больных туберкулёзом лёгких. Каждое изображение имело разрешение 572 х 422 пикселей. Для автоматизированной сегментации изображений использовалось двумерное вейвлет-преобразование Mexican Hat Wavelet. Результаты. По результатам исследования установлено оптимальное значение стандартного отклонения, которое является единственным варьирующимся параметром вейвлета Mexican Hat, а также произведена оценка времени выполнения вейвлет-преобразования цифровых микроскопических изображений мокроты, окрашенной по методу Циля - Нильесна. Заключение. По результатам исследования сделано заключение о том, что использование двумерного вейвлет-преобразования Mexican Hat цифровых микроскопических изображений мокроты, окрашенной по методу Циля - Нильсена, позволяет сегментировать данные изображения, что может быть использовано для последующей разработки систем автоматизированной бактериоскопической диагностики туберкулёза.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Background. Currently at bacterioscopic diagnosis of tuberculosis there is a large number of errors that is associated with a number of problems that can be solved by automated analysis of microscopic images of sputum. Automated image analysis usually consists of several stages: image segmentation and identification or recognition of objects in the image. The article examines the first of these stages - segmentation. The aim of the study was to investigate the possibility of segmenting a digital image of a microscopic preparation sputum, stained by the method of Ziehl - Nielsen, using wavelet transform Mexican Hat. Materials and methods. As research material we used 830 digital images obtained by microscopy of sputum smears stained by the method of Ziehl - Nielsen. For the automated segmentation of images we used two-dimensional wavelet transform of Mexican Hat Wavelet. Results. During the study we defined the optimal value of the a parameter, which is the only varying parameter of a wavelet Mexican Hat, and carried out the run-time evaluation of the wavelet transform digital microscopic images of sputum stained by the method of Ziehl - Nielsen. Conclusions. The conclusion is made about possibility of using two-dimensional wavelet transform Mexican Hat digital microscopic images of sputum stained by the method of Ziehl - Nielsen, for segmentation of these images.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>медицинские изображения</kwd><kwd>анализ изображений</kwd><kwd>автоматизированная обработка</kwd><kwd>бактериоскопическая диагностика</kwd><kwd>туберкулёз лёгких</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>medical imaging</kwd><kwd>image analysis</kwd><kwd>automatic data processing</kwd><kwd>bacteriological technic</kwd><kwd>pulmonary tuberculosis</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Еремеева Н.И., Вахрушева Д.В. Эффективность выявления больных туберкулезом с бактериовыделением в клинико-диагностических лабораториях учреждений первичной медико-санитарной помощи Урала в 2010-2012 гг. // Туберкулез и болезни легких. - 2015. - № 7. - С. 40-42</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Еремеева Н.И., Вахрушева Д.В. Эффективность выявления больных туберкулезом с бактериовыделением в клинико-диагностических лабораториях учреждений первичной медико-санитарной помощи Урала в 2010-2012 гг. // Туберкулез и болезни легких. - 2015. - № 7. - С. 40-42</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Косых Н.Э., Смагин С.И., Гостюшкин В.В., Савин С.З., Литвинов К.А. Система автоматизированного компьютерного анализа медицинских изображений // Информационные технологии и вычислительные системы. - 2011. - № 3. - С. 51-56</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Косых Н.Э., Смагин С.И., Гостюшкин В.В., Савин С.З., Литвинов К.А. Система автоматизированного компьютерного анализа медицинских изображений // Информационные технологии и вычислительные системы. - 2011. - № 3. - С. 51-56</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Мезенцева Н.И., Евгущенко Г.В., Пузанов В.А., Попов С.А., Фрейман Г.Е. Оценка качества диагностики туберкулеза методами микроскопии в РФ за 2011-2014 гг. по результатам ФСВОК // Туберкулез и болезни легких. - 2015. - № 6. - С. 96-97</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Мезенцева Н.И., Евгущенко Г.В., Пузанов В.А., Попов С.А., Фрейман Г.Е. Оценка качества диагностики туберкулеза методами микроскопии в РФ за 2011-2014 гг. по результатам ФСВОК // Туберкулез и болезни легких. - 2015. - № 6. - С. 96-97</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Мордык А.В., Пузырева Л.В., Аксютина Л.П. Современные международные и национальные концепции борьбы с туберкулезом // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2013. - № 22. - С. 92-97</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Мордык А.В., Пузырева Л.В., Аксютина Л.П. Современные международные и национальные концепции борьбы с туберкулезом // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2013. - № 22. - С. 92-97</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Порев В.Н. Компьютерная графика. - СПб.: БХВ-Петербург, 2002. - 432 с</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Порев В.Н. Компьютерная графика. - СПб.: БХВ-Петербург, 2002. - 432 с</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Сойфер В.А. Компьютерная обработка изображений. Часть 2. Методы и алгоритмы // Соросовский образовательный журнал. - 1996. - № 3. - С. 110-121</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Сойфер В.А. Компьютерная обработка изображений. Часть 2. Методы и алгоритмы // Соросовский образовательный журнал. - 1996. - № 3. - С. 110-121</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Филимонова Е.С., Тарасенко С.Л., Дыхно Ю.А., Хлебникова Ф.Б. Оценка эффективности цитологической диагностики злокачественных новообразований легких // Сибирское медицинское обозрение. - 2014. -№ 3. - С. 65-69</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Филимонова Е.С., Тарасенко С.Л., Дыхно Ю.А., Хлебникова Ф.Б. Оценка эффективности цитологической диагностики злокачественных новообразований легких // Сибирское медицинское обозрение. - 2014. -№ 3. - С. 65-69</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Чередниченко А.Г., Ревякина О.В., Петренко Т.И. Состояние лабораторной службы по диагностике туберкулеза в Сибирском и Дальневосточном федеральных округах // Туберкулез и болезни легких. -2014. - № 5. - С. 16-20</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Чередниченко А.Г., Ревякина О.В., Петренко Т.И. Состояние лабораторной службы по диагностике туберкулеза в Сибирском и Дальневосточном федеральных округах // Туберкулез и болезни легких. -2014. - № 5. - С. 16-20</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Agoston M.K. (2005). Computer graphics and geometric modeling: implementation and algorithms, London, 907 p.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Agoston M.K. (2005). Computer graphics and geometric modeling: implementation and algorithms, London, 907 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Cazelles B., Cazelles K., Chavez M. (2013). Wavelet analysis in ecology and epidemiology: impact of statistical tests. J R Soc Interface, (91), 20130585.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cazelles B., Cazelles K., Chavez M. (2013). Wavelet analysis in ecology and epidemiology: impact of statistical tests. J R Soc Interface, (91), 20130585.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Cheng R., Bai Y., Hu H., Tan X. (2015). Radial wavelet neural network with a novel self-creating disk-cell-splitting algorithm for license plate character recognition. Entropy (Basel), (6), 3857-3876.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cheng R., Bai Y., Hu H., Tan X. (2015). Radial wavelet neural network with a novel self-creating disk-cell-splitting algorithm for license plate character recognition. Entropy (Basel), (6), 3857-3876.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hsu C.Y., Lai Y.L., Chen C.C., Lee Y.T., Tseng K.K., Lai Y.K., Zheng C.Y., Jheng H.C. (2015). Time sequence image analysis of positron emission tomography using wavelet transformation. Technol Health Care, (24), 393-400.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hsu C.Y., Lai Y.L., Chen C.C., Lee Y.T., Tseng K.K., Lai Y.K., Zheng C.Y., Jheng H.C. (2015). Time sequence image analysis of positron emission tomography using wavelet transformation. Technol Health Care, (24), 393-400.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Jin F., Feng D. (2014). Image registration algorithm using Mexican hat function-based operator and grouped feature matching strategy. PLoS One, (4), e95576.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Jin F., Feng D. (2014). Image registration algorithm using Mexican hat function-based operator and grouped feature matching strategy. PLoS One, (4), e95576.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Liu D., Wang S., Huang D., Deng G., Zeng F., Chen H. (2016). Medical image classification using spatial adjacent histogram based on adaptive local binary patterns. Comput Biol Med, (72), 185-200.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Liu D., Wang S., Huang D., Deng G., Zeng F., Chen H. (2016). Medical image classification using spatial adjacent histogram based on adaptive local binary patterns. Comput Biol Med, (72), 185-200.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Megardon G., Tandonnet C., Sumner P., Guillaume A. (2015). Limitations of short range Mexican hat connection for driving target selection in a 2D neural field: activity suppression and deviation from input stimuli. Front Comput Neurosci, (9), 128.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Megardon G., Tandonnet C., Sumner P., Guillaume A. (2015). Limitations of short range Mexican hat connection for driving target selection in a 2D neural field: activity suppression and deviation from input stimuli. Front Comput Neurosci, (9), 128.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ou X., Pan W., Zhang X., Xiao P. (2016) Skin image retrieval using Gabor wavelet texture feature. Int J Cosmet Sci, (6), 607-614.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ou X., Pan W., Zhang X., Xiao P. (2016) Skin image retrieval using Gabor wavelet texture feature. Int J Cosmet Sci, (6), 607-614.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Xionga F., Oib X., Nattela S., Comtoisb P. (2015) Wavelet analysis of cardiac optical mapping data. Comput Biol Med, (65), 243-255.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Xionga F., Oib X., Nattela S., Comtoisb P. (2015) Wavelet analysis of cardiac optical mapping data. Comput Biol Med, (65), 243-255.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Xu Z., Bagci U., Mansoor A., Kramer-Marek G., Luna B., Kubler A., Dey B., Foster B., Papadakis G.Z., Camp J.V., Jonsson C.B., Bishai W.R., Jain S., Udupa J.K., Mollura D.J. (2015). Computer-aided pulmonary image analysis in small animal models. Med Phys, (7), 3896-3910.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Xu Z., Bagci U., Mansoor A., Kramer-Marek G., Luna B., Kubler A., Dey B., Foster B., Papadakis G.Z., Camp J.V., Jonsson C.B., Bishai W.R., Jain S., Udupa J.K., Mollura D.J. (2015). Computer-aided pulmonary image analysis in small animal models. Med Phys, (7), 3896-3910.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
