actabiomedicaActa Biomedica ScientificaActa Biomedica Scientifica2541-94202587-9596Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems10.12737/article_59e8bcec3d9752.57563902actabiomedica-436Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯ И ВИРУСОЛОГИЯMICROBIOLOGY AND VIRUSOLOGYХарактеристика генетических и фенотипических свойств штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных из различных источников на территории Восточной СибириCharacteristics of genetic and phenotypic properties of tick-borne encephalitis virus strains isolated from various source on the territory of Eastern SiberiaВерхозинаМ. М.VerkhozinaM. M.mverkhoz@rambler.ruКозловаИ. В.KozlovaI. V.diwerhoz@rambler.ruДорощенкоЕ. К.DoroshchenkoE. K.doroshchenko-virus@mail.ruЛисакО. В.LisakO. V.lisak.liza@rambler.ruДеминаТ. В.DeminaT. B.demina2006@mail.ruТкачевС. Е.TkachevS. E.sergey.e.tkachev@mail.ruДжиоевЮ. П.DzhioevYu. P.alanir07@mail.ruСунцоваО. В.SuntsovaO. V.olga_syntsova@list.ruСавиноваЮ. С.SavinovaYu. S.vippersona2389@rambler.ruПарамоновА. И.ParamonovA. I.paramonov_a.i@mail.ruЗлобинВ. И.ZlobinV. I.vizlobin@mail.ruФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области»Centre of Hygiene and Epidemiology in the Irkutsk RegionФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction ProblemsФГБОУ ВО «Иркутский государственный аграрный университет им. А.А. Ежевского»Irkutsk State Agrarian University named after A.A. EzhevskyФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАНInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of SciencesФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииIrkutsk State Medical University20172809201725(1)7682Copyright © Верхозина М.М., Козлова И.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Демина Т.В., Ткачев С.Е., Джиоев Ю.П., Сунцова О.В., Савинова Ю.С., Парамонов А.И., Злобин В.И., 20172017Верхозина М.М., Козлова И.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Демина Т.В., Ткачев С.Е., Джиоев Ю.П., Сунцова О.В., Савинова Ю.С., Парамонов А.И., Злобин В.И.Verkhozina M.M., Kozlova I.V., Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Demina T.B., Tkachev S.E., Dzhioev Y.P., Suntsova O.V., Savinova Y.S., Paramonov A.I., Zlobin V.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/436

В связи с тем, что основу формирования популяции вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) составляют иксодовые клещи и их прокормители - позвоночные животные, представляло интерес получение генетической характеристики штаммов, выделенных из различных источников на территории Восточной Сибири. В ходе проведённого исследования установлено, что циркуляция ВКЭ генотипов 1, 2, 3, 5 и «политиповых» штаммов на территории Восточной Сибири поддерживается как основными переносчиками (клещами I. persulcatus), так и их прокормителями (мелкими и крупными млекопитающими, птицами). Распределение генотипов в группах штаммов от иксодовых клещей и позвоночных животных различалось. Штаммы ВКЭ генотипов 1 и 2 статистически значимо чаще выделялись от грызунов, штаммы генотипа 3 - от иксодовых клещей (p < 0,05). В группе штаммов, изолированных от иксодовых клещей, преобладали изоляты генотипа 3 (85,5 %), из которых 29,6 % составили штаммы субгенотипа «Васильченко», 25,6 % - штаммы субгенотипа «Заусаев». Генотипы 1 и 2 были представлены единичными изолятами (3,3 % и 1,3 % соответственно). Среди штаммов, изолированных от теплокровных хозяев, доля генотипа 1 составила 35,3 %, генотипа 2 -11,8 %, генотипа 3 - 35,3 %. Более половины штаммов генотипа 3 (58,3 %) были отнесены к субгенотипу «Васильченко», штаммов субгенотипа «Заусаев» не выявлено. Полученные данные позволяют предположить, что иксодовые клещи являются амплификаторами ВКЭ генотипа 3, а теплокровные животные -амплификаторами ВКЭ генотипа 1. Выявлены определённые различия фенотипических признаков штаммов, изолированных от клещей и теплокровных животных. Установлено, что штаммы, изолированные от клещей, более однородны по своей антигенной характеристике, менее гетерогенны по S-признаку, чем штаммы, выделенные от теплокровных источников. Штаммы, выделенные от теплокровных животных, проявляют несколько большую устойчивость к прогреванию при одновременном снижении репродукции вируса при температуре 42 °С, обладают большей вирулентностью, по сравнению со штаммами, выделенными от клещей.

Since ixodid ticks and their feeders (vertebrates) form the basis of the tick-borne encephalitis virus (TBEV) population, it was interesting to obtain a genetic characteristic of strains isolated from various sources in the territory of Eastern Siberia. In our study, it was found that the circulation of TBEV of genotypes 1, 2, 3, 5 and "polytypic" strains in the territory of Eastern Siberia is maintained both by the main vectors (I. persulcatus ticks) and by their feeders (small and large mammals, birds). The distribution of genotypes in strains groups from ixodid ticks and vertebrates varied. TBEV strains of genotypes 1 and 2 were significantly more often isolated from rodents, and genotype 3 from ixodid ticks (p < 0.05). Isolates of genotype 3 (85.5 %) prevailed in the group of strains isolated from ixodid ticks, of which 29.6 % belonged to "Vasilchenko", and 25.6 % to "Zausaev"subgenotypes. Genotypes 1 and 2 were represented by single isolates (3.3 % and 1.3 %, respectively). Among strains isolated from warm-blooded hosts, the proportion of genotype 1 was 35.3 %, genotype 2 -11.8 %, genotype 3 - 35.3 %. More than half of genotype 3 strains (58.3 %) were related to "Vasilchenko" subgenotype, and the strains of "Zausaev" subgenotype were not detected. The obtained data suggest that ixodid ticks and warm-blooded animals are amplifiers of TBEV of genotypes 3 and 1, respectively. The certain differences in the phenotypic characteristics of strains isolated from ticks and warm-blooded animals have been revealed. It has been found that strains isolated from ticks are more homogeneous in their antigenic characteristics, less heterogeneous in S-feature than strains isolated from warm-blooded sources. The strains isolated from warm-blooded animals demonstrate somewhat greater resistance to warming but reducing the reproduction of the virus at 42 °C, and have greater virulence compared to strains isolated from ticks.

вирус клещевого энцефалитагенотипгенетические свойствафенотипические свойствагенетические маркерыисточник изоляцииВосточная Сибирьtick-borne encephalitis virusgenotypegenetic propertiesphenotypic propertiesgenetic markerssource of isolationEastern SiberiaReferencesГерасимов С.Г., Погодина В.В., Колясникова Н.М., Карань Л.С., Маленко Г.В., Левина Л.С. Взаимодействие Сибирского и Дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита при микстинфекции в организме млекопитающих. Факторы, влияющие на тип взаимодействия // Вопросы вирусологии. - 2011. -Т. 56, № 2. - С. 19-22Герасимов С.Г., Погодина В.В., Колясникова Н.М., Карань Л.С., Маленко Г.В., Левина Л.С. Взаимодействие Сибирского и Дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита при микстинфекции в организме млекопитающих. Факторы, влияющие на тип взаимодействия // Вопросы вирусологии. - 2011. -Т. 56, № 2. - С. 19-22Емельянова Н.Д., Захлебная О.Д. О роли пернатых в циркуляции вируса клещевого энцефалита в природных очагах Восточной Сибири и Дальнего Востока // Современные проблемы эпидемиологии, диагностики и профилактики клещевого энцефалита: Тез. докл. Всесоюзного симпозиума (Иркутск, 18-21 сент. 1990 г.). - Иркутск, 1990. - С. 39-40Емельянова Н.Д., Захлебная О.Д. О роли пернатых в циркуляции вируса клещевого энцефалита в природных очагах Восточной Сибири и Дальнего Востока // Современные проблемы эпидемиологии, диагностики и профилактики клещевого энцефалита: Тез. докл. Всесоюзного симпозиума (Иркутск, 18-21 сент. 1990 г.). - Иркутск, 1990. - С. 39-40Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М., Козлова И.В., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Злобин В.И. Генотипирование вируса клещевого энцефалита в природных и антропургических очагах Евразии по результатам мультилокусной гибридизации // Инфекции, передаваемые клещами в Сибирском регионе. - Новосибирск, 2011. - С. 139-153Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М., Козлова И.В., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Злобин В.И. Генотипирование вируса клещевого энцефалита в природных и антропургических очагах Евразии по результатам мультилокусной гибридизации // Инфекции, передаваемые клещами в Сибирском регионе. - Новосибирск, 2011. - С. 139-153Дживанян Т.И., Королев М.Б., Караганова Г.Г., Лисак В.М., Каштанова Г.Н., Чупринская М.В. Изменение зависимых от хозяина характеристик вируса клещевого энцефалита при его адаптации к клещам и переадаптации к белым мышам // Вопросы вирусологии. - 1988. - № 5. - С. 589-595Дживанян Т.И., Королев М.Б., Караганова Г.Г., Лисак В.М., Каштанова Г.Н., Чупринская М.В. Изменение зависимых от хозяина характеристик вируса клещевого энцефалита при его адаптации к клещам и переадаптации к белым мышам // Вопросы вирусологии. - 1988. - № 5. - С. 589-595Карань Л.С., Маленко Г.В., Бочкова Н.Г., Левина Л.С., Ливанова Г.П., Колясникова Н.М., Гамова Е.Г., Трухина А.Г., Злобин В.И., Верхозина М.М., Козлова И.В., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Погодина В.В. Применение молекулярно-генетических методов для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 34-40Карань Л.С., Маленко Г.В., Бочкова Н.Г., Левина Л.С., Ливанова Г.П., Колясникова Н.М., Гамова Е.Г., Трухина А.Г., Злобин В.И., Верхозина М.М., Козлова И.В., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Погодина В.В. Применение молекулярно-генетических методов для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 34-40Ковалев С.Ю., Умпелова Т.В., Снитковская Т.Э., Килячина А.С., Романенко В.В., Кокорев В.С, Глинских Н.П. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вируса клещевого энцефалита на территории Свердловской области на основе генотипспецифической ОТ-ПЦР // Вопросы вирусологии. - 2008. - № 2. - С. 27-31Ковалев С.Ю., Умпелова Т.В., Снитковская Т.Э., Килячина А.С., Романенко В.В., Кокорев В.С, Глинских Н.П. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вируса клещевого энцефалита на территории Свердловской области на основе генотипспецифической ОТ-ПЦР // Вопросы вирусологии. - 2008. - № 2. - С. 27-31Леонова Г.Н. Клещевой энцефалит в Приморском крае. - Владивосток: Дальнаука, 1997. - 187 сЛеонова Г.Н. Клещевой энцефалит в Приморском крае. - Владивосток: Дальнаука, 1997. - 187 сЛеонова Г.Н., Мураткина С.М., Кругляк С.П. Изучение вирулентности штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на юге Советского Дальнего Востока // Вопросы вирусологии. - 1990. -№ 5. - С. 399-401Леонова Г.Н., Мураткина С.М., Кругляк С.П. Изучение вирулентности штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на юге Советского Дальнего Востока // Вопросы вирусологии. - 1990. -№ 5. - С. 399-401Ткачев С.Е., Ливанова Н.Н., Ливанов С.Г. Исследование генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита сибирского генетического типа, выявленного в клещах I. persulcatus на Северном Урале в 2006 году // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). - С. 49-52Ткачев С.Е., Ливанова Н.Н., Ливанов С.Г. Исследование генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита сибирского генетического типа, выявленного в клещах I. persulcatus на Северном Урале в 2006 году // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). - С. 49-52Цилинский Я.Я. Популяционная структура и эволюция вирусов. - М.: Медицина, 1988. - 239 сЦилинский Я.Я. Популяционная структура и эволюция вирусов. - М.: Медицина, 1988. - 239 сJaaskelainen A.E., Tikkakosk T., Uzcategui N.Y., Alekseev A.N., Vaheri A., Vapalahti O. (2006). Siberian subtype tick-borne encephalitis virus, Finland. Emerg Infect Dis, 12 (10), 1568-1571.Jaaskelainen A.E., Tikkakosk T., Uzcategui N.Y., Alekseev A.N., Vaheri A., Vapalahti O. (2006). Siberian subtype tick-borne encephalitis virus, Finland. Emerg Infect Dis, 12 (10), 1568-1571.Romanova L.Iu, Gmyl A.P., Dzhivanian T.I., Bakhmutov D.V., Lukashev A.N., Gmyl L.V., Rumyantsev A.A., Burenkova L.A., Lashkevich V.A., Karganova G.G. (2007). Microevolution of tick-borne encephalitis virus in course of host alternation. Virology, 362 (1), 75-84.Romanova L.Iu, Gmyl A.P., Dzhivanian T.I., Bakhmutov D.V., Lukashev A.N., Gmyl L.V., Rumyantsev A.A., Burenkova L.A., Lashkevich V.A., Karganova G.G. (2007). Microevolution of tick-borne encephalitis virus in course of host alternation. Virology, 362 (1), 75-84.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.