actabiomedicaActa Biomedica ScientificaActa Biomedica Scientifica2541-94202587-9596Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems10.12737/article_59e8bd10164039.21079786actabiomedica-435Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯ И ВИРУСОЛОГИЯMICROBIOLOGY AND VIRUSOLOGYРаспространение генотипов вируса клещевого энцефалита в различных типах ландшафтов Восточной СибириThe distribution of tick-borne encephalitis virus genotypes in different types of landscapes of Eastern SiberiaВерхозинаМ. М.VerkhozinaM. M.mverkhoz@rambler.ruКозловаИ. В.KozlovaI. V.diwerhoz@rambler.ruДорощенкоЕ. К.DoroshchenkoE. K.virus@mail.ruЛисакО. В.LisakO. V.lisak.liza@rambler.ruДеминаТ. В.DeminaT. B.demina2006@mail.ruТкачевС. Е.TkachevS. E.sergey.e.tkachev@mail.ruДжиоевЮ. П.DzhioevYu. P.alanir07@mail.ruСунцоваО. В.SuntsovaO. V.olga_syntsova@list.ruСавиноваЮ. С.SavinovaYu. S.vippersona2389@rambler.ruПарамоновА. И.ParamonovA. I.paramonov_a.i@mail.ruЗлобинВ. И.ZlobinV. I.vizlobin@mail.ruФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области»Centre of Hygiene and Epidemiology in the Irkutsk RegionФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction ProblemsФГБОУ ВО «Иркутский государственный аграрный университет им. А.А. Ежевского»Irkutsk State Agrarian University named after A.A. EzhevskyФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАНInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of SciencesФГБОУ ВО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииIrkutsk State Medical University20172809201725(1)6975Copyright © Верхозина М.М., Козлова И.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Демина Т.В., Ткачев С.Е., Джиоев Ю.П., Сунцова О.В., Савинова Ю.С., Парамонов А.И., Злобин В.И., 20172017Верхозина М.М., Козлова И.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Демина Т.В., Ткачев С.Е., Джиоев Ю.П., Сунцова О.В., Савинова Ю.С., Парамонов А.И., Злобин В.И.Verkhozina M.M., Kozlova I.V., Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Demina T.B., Tkachev S.E., Dzhioev Y.P., Suntsova O.V., Savinova Y.S., Paramonov A.I., Zlobin V.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/435

Для поиска ответа на вопрос о роли некоторых экологических факторов в формировании гетерогенной вирусной популяции проведён анализ распространения генотипов вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) в различных типах ландшафтов Восточной Сибири. В ходе исследования показано, что ареал ВКЭ на всех обследованных ландшафтных территориях Восточной Сибири представлен не только ВКЭ генотипа 3, абсолютное доминирование которого отмечено в изученных районах независимо от того, в каких ландшафтных зонах расположены очаги, но и штаммами других генотипов. Связь генотипов 1, 3 и «политиповых» штаммов с определённым видом ландшафта и степенью их освоенности человеком не установлена. Преобладающее количество штаммов ВКЭ генотипа 5 выделено из материала, собранного в Забайкалье, в ландшафтах горной тайги. Они так же, как и штамм генотипа 4, обнаруживаются в очагах, где отмечена совместная циркуляция нескольких генотипов ВКЭ. Штаммы ВКЭ генотипа 2 выявлены в ландшафтах тайги равнин и плато и островных степей и лесостепей южной части Предбайкалья. Кроме того, обнаружение РНК ВКЭ генотипа 2 в составе «политиповых» штаммов 763-87 и 765-87, выделенных в пойменных и лесостепных ландшафтах Баргузинской котловины, не исключает вероятность циркуляции ВКЭ генотипа 2 в очагах Забайкалья. Наибольшая генетическая вариабельность отмечена в районах, располагающихся вдоль озера Байкал, а также в юго-восточной части Забайкалья.

To find out what is the role of some environmental factors in the formation of a heterogeneous viral population, the analysis of the distribution of tick-borne encephalitis virus (TBEV) genotypes in different types of landscapes of Eastern Siberia has been carried out. In our study, it was shown that TBEV area in all investigated landscapes of Eastern Siberia is represented not only by TBEV of genotype 3, absolute dominance of which is noted in the studied regions, regardless the landscapes where the foci are located, but also by strains of other genotypes. The relationship between genotypes 1,3 and "polytypic" strains with a certain type of landscape and the degree of their development by man has not been established. The prevailing number of strains of TBEV genotype 5 is isolated from the material collected in the Transbaikalia, in the landscapes of the mountain taiga. They, as well as the strain of genotype 4, are found in the foci, where joint circulation of several TBEV genotypes is noted. The strains of TBEV genotype 2 were revealed in the landscapes of plains and plateaus taiga and insular steppes and forest steppes of the southern part of the Baikal region. Moreover, the detection of RNA of TBEV genotype 2 in the "polytipic" 763-87 and 765-87 strains isolated in the floodplain and forest-steppe landscapes of the Barguzin hollow does not exclude the possibility of circulation of TBEV genotype 2 in the Transbaikalian foci. The greatest genetic heterogeneity of TBEV is observed in natural foci located along Lake Baikal and in the southeastern part of Transbaikalia.

вирус клещевого энцефалитагенотиптип ландшафтаВосточная Сибирьtick-borne encephalitis virusgenotypelandscape typeEastern SiberiaReferencesВерхозина М.М., Злобин В.И., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Беликов С.И., Борисов В.А., Данчинова Г.А., Арбатская Е.В., Лисак О.В., Дорощенко Е.К., Протасова Е.Г. Эколого-генетический анализ популяции вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 53-59Верхозина М.М., Злобин В.И., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Беликов С.И., Борисов В.А., Данчинова Г.А., Арбатская Е.В., Лисак О.В., Дорощенко Е.К., Протасова Е.Г. Эколого-генетический анализ популяции вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 53-59Верхозина М.М., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Карань Л.С., Ткачев С.Е., Злобин В.И. Молекулярно-эпидемиологическая и эколого-географическая характеристика вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Инфекции, передаваемые клещами в Сибирском регионе. - 2011. - С. 84-108Верхозина М.М., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Карань Л.С., Ткачев С.Е., Злобин В.И. Молекулярно-эпидемиологическая и эколого-географическая характеристика вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Инфекции, передаваемые клещами в Сибирском регионе. - 2011. - С. 84-108Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Верхозина М.М., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Парамонов А.И., Злобин В.И.. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов и возможный сценарий их формирования // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 4. - С. 12-19Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Верхозина М.М., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Парамонов А.И., Злобин В.И.. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов и возможный сценарий их формирования // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 4. - С. 12-19Злобин В.И., Борисов В.А., Верхозина М.М., Малов И.В., Холмогорова Г.Н.. Клещевой энцефалит в Восточной Сибири. - Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2002. - 182 сЗлобин В.И., Борисов В.А., Верхозина М.М., Малов И.В., Холмогорова Г.Н.. Клещевой энцефалит в Восточной Сибири. - Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2002. - 182 сКозлова И.В., Верхозина М.М., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Ткачев С.Е., Карань Л.С., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Сунцова О.В., Парамонов А.И., Черноиванова О.О., Ревизор А.О., Злобин В.И. Генетические и биологические свойства оригинальной группы штаммов вируса клещевого энцефалита, циркулирующей в Восточной Сибири // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - № 64. - С. 14-25Козлова И.В., Верхозина М.М., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Ткачев С.Е., Карань Л.С., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Сунцова О.В., Парамонов А.И., Черноиванова О.О., Ревизор А.О., Злобин В.И. Генетические и биологические свойства оригинальной группы штаммов вируса клещевого энцефалита, циркулирующей в Восточной Сибири // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - № 64. - С. 14-25Львов Д.К., Ильичев В.Д. Миграция птиц и перенос возбудителей инфекций. - М.: Наука, 1979. - 270 сЛьвов Д.К., Ильичев В.Д. Миграция птиц и перенос возбудителей инфекций. - М.: Наука, 1979. - 270 сDudley J., Nei M., Kumar S. (2007). MEGA 4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Mol Biol Evol, 24, 1596-1599.Dudley J., Nei M., Kumar S. (2007). MEGA 4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Mol Biol Evol, 24, 1596-1599.Hayasaka D., Suzuki Y., Kariva H. (1999). Phylogenetic and virulence analysis of tick-borne encephalitis viruses from Japan and far-eastern Russia. J Gen Virol, 80 (12), 3127-3135.Hayasaka D., Suzuki Y., Kariva H. (1999). Phylogenetic and virulence analysis of tick-borne encephalitis viruses from Japan and far-eastern Russia. J Gen Virol, 80 (12), 3127-3135.Hoogstraal H., Kaiser M.N., Traylor M.A. (1963). Ticks (Ixodidae) on birds migrating from Europe and Asia to Africa 1956-1961. Bull World Health Organ, 28, 235-262.Hoogstraal H., Kaiser M.N., Traylor M.A. (1963). Ticks (Ixodidae) on birds migrating from Europe and Asia to Africa 1956-1961. Bull World Health Organ, 28, 235-262.Waldenstrum J., Lundkvist A., Falk K.I. (2007). Migrating birds and tick-borne encephalitis viruses. Emerg Infect Dis, 13 (8), 1215-1218.Waldenstrum J., Lundkvist A., Falk K.I. (2007). Migrating birds and tick-borne encephalitis viruses. Emerg Infect Dis, 13 (8), 1215-1218.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.