младший научный сотрудник лаборатории микробиома и микроэкологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Junior Research Officer at the Laboratory of Microbiome and Microecology
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
кандидат биологических наук, доцент, ведущий научный сотрудник, заведующий лабораторией микробиома и микроэкологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Cand. Sc. (Biol.), Associate Professor, Leading Research Officer at the Laboratory of Microbiome and Microecology
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории микробиома и микроэкологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории микробиома и микроэкологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
кандидат биологических наук, младший научный сотрудник лаборатории микробиома и микроэкологии
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
заместитель главного врача по санитарно-эпидемиологической работе, ГБУЗ «Иркутская государственная областная детская клиническая больница»; младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально-значимых инфекций
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Deputy Chief Physician for Sanitary and Epidemiological Work, Irkutsk State Regional Children’s Clinical Hospital; Junior Research Officer at the Laboratory of Epidemiologically and Socially Important Infections
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой эпидемиологии и микробиологии, Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России; главный научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально-значимых инфекций
664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия
Dr. Sc. (Med.), Professor, Head of the Department of Epidemiology and Microbiology, Irkutsk State Medical Academy of Continuing Education – Branch of the Russian Medical Academy of Continuing Professional Education; Chief Research Officer at the Laboratory of Epidemiologically and Socially Important Infections
Timiryaseva str. 16, Irkutsk 664003, Russian Federation
В многопрофильных стационарах имеются условия, способствующие возникновению инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи: высокая концентрация лиц со сниженным иммунитетом на ограниченной территории, наличие значительного числа источников инфекции (больных и носителей), изменение биоценоза слизистых оболочек и кожных покровов у пациентов и медицинского персонала под влиянием широкого применения антибиотиков и цитостатиков.
Цель исследования состояла в сопоставлении стандартизированных бактериологических алгоритмов и системы MALDI Biotyper в микробиологической диагностике возбудителей инфекций на примере заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи.
Материалы и методы. Обследовано 78 пациентов детского многопрофильного стационара регионального уровня (г. Иркутск) в 2018–2019 гг. Возраст больных составил от 1 года до 15 лет. Материалом для исследования служили кровь, мокрота, смывы с трахеобронхиального дерева, зева, носа, раневое отделяемое, жидкость брюшной полости, ликвор и смывы с объектов окружающей среды. Идентификацию выделенных культур (78 штаммов бактерий) осуществляли общепринятыми бактериологическими методами, а также с использованием системы MALDI Biotyper.
Результаты и обсуждения. В структуре инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, лидирующие позиции занимал вид Pseudomonas aeruginosa. Стандартизированными бактериологическими методами удалось идентифицировать не все изоляты микроорганизмов. Более надёжной стала идентификация штаммов с характерными проявлениями физиолого-биохимических признаков. Трудности идентификации возникали при наличии атипичных свойств микроорганизмов, когда использование MALDI Biotyper имело решающее значение.
Заключение. Для проведения надёжной диагностики возбудителей инфекций необходимо применять комплексный подход, включающий стандартизированные бактериологические методы и методы идентификации микроорганизмов с помощью масс-спектрометрии на последующих этапах.
In multidisciplinary hospitals, there are conditions conducive to the emergence of healthcare-associated infections: high concentration of people with reduced immunity in a limited area, the presence of a significant number of sources of contagion (patients and carriers), a change in the biocenosis of the mucous membranes and skin of patients and medical personnel under the influence of widespread use of antibiotics and cytostatics.
The aim of the research was in the intercomparison of the standardized bacteriological algorithms and the MALDI Biotyper system in the microbiological diagnosis of pathogens as illustrated by the healthcare-associated diseases.
Materials and methods. Seventy-eight patients of a multidisciplinary hospital of a regional level (Irkutsk) in 2018–2019 were examined. The age of patients ranged from 1 to 15 years. The material for the study was blood, sputum, swabs from the tracheobronchial tree, throat, nose, wound, abdominal fluid, cerebrospinal fluid, and swabs from environmental objects. Identification of the isolated cultures (78 bacterial strains) was carried out using generally accepted bacteriological methods, as well as using the MALDI Biotyper system.
Results and discussions. In the structure of healthcare-associated infections, Pseudomonas aeruginosa occupied a leading position. Not all isolates of microorganisms were identified by standardized bacteriological methods. The identification of strains with characteristic manifestations of physiological and biochemical characteristics was more reliable. Identification difficulties arose in the presence of atypical properties of microorganisms when the use of MALDI Biotyper would be crucial.
Conclusion. It is necessary to apply an integrated approach to conduct reliable diagnostics of pathogens. It includes standardized bacteriological methods and methods for identifying microorganisms using mass spectrometry in the subsequent stages.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.