actabiomedicaActa Biomedica ScientificaActa Biomedica Scientifica2541-94202587-9596Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problemsactabiomedica-1821Research ArticleГЕНОМИКА И ПРОТЕОМИКАGENOMICS AND PROTEOMICSДетекция некоторых генов, кодирующих факторы патогенности у типичных изолятов Escherichia coliDetection of some genes encoding pathogenicity factors in the typical isolates of Escherichia coliИвановаЕ. И.IvanovaE. I.noemail@neicon.ruПопковаС. М.PopkovaS. M.noemail@neicon.ruДжиоевЮ. П.DzhioevY. P.alanir07@mail.ruДолгихВ. В.DolgikhV. V.noemail@neicon.ruРаковаЕ. Б.RakovaE. B.noemail@neicon.ruБухароваЕ. В.BukharovaE. V.buxarowa.ekaterina@yandex.ruНаучный центр проблем здоровья семьи и репродукции человекаScientific Center for Family Health and Human Reproduction ProblemsНаучный центр проблем здоровья семьи и репродукции человекаScientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems201428092014058994Copyright © Иванова Е.И., Попкова С.М., Джиоев Ю.П., Долгих В.В., Ракова Е.Б., Бухарова Е.В., 20142014Иванова Е.И., Попкова С.М., Джиоев Ю.П., Долгих В.В., Ракова Е.Б., Бухарова Е.В.Ivanova E.I., Popkova S.M., Dzhioev Y.P., Dolgikh V.V., Rakova E.B., Bukharova E.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/1821

С помощью ПЦР исследовали 316 штаммов разных типов E. coli (с нормальной ферментативной активностью, со слабой ферментативной активностью, гемолитической активностью), выделенных у здоровых детей и детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта, на наличие генов патогенности. Проведенные исследования показали, что штаммы Escherichia coli обладают патогенным потенциалом, о чем свидетельствует наличие у них генетических маркеров патогенности.

Using polymerase chain reaction 316 strains of E. coli (strains with normal enzymatic activity, strains with weak enzymatic activity and strains with hemolytic activity) were examined for the presence of pathogenicity genes. They were isolatedfrom healthy children and children with functional disorders of the gastro-intestinal tract. The studies have shown that strains of Escherichia coli have pathogenic potential, as evidenced by the presence of genetic pathogenicity markers in them.

кишечный микробиоценозфункциональные нарушения пищеварениягены патогенностиПЦРпраймерыEscherichia coli«острова» патогенностиintestinal microbiocenosisEscherichia colifunctional digestive disorderspathogenicity islandspathogenicity genesPCRprimersReferencesАветисян Л.Р. Эпидемиологические и микробиологические аспекты колонизации кишечника детей первого года жизни условно-патогенными микроорганизмами: дис. ... канд. мед. наук. - М., 2008. - 143 сАветисян Л.Р. Эпидемиологические и микробиологические аспекты колонизации кишечника детей первого года жизни условно-патогенными микроорганизмами: дис. ... канд. мед. наук. - М., 2008. - 143 сБережной В.В., Крамарев С.А., Шунько Е.Е., Янковский Д.С. и др. Микрофлора человека и роль современных пробиотиков в ее регуляции // Здоровье женщины. - 2004. - № 1 (17). - С. 134-139Бережной В.В., Крамарев С.А., Шунько Е.Е., Янковский Д.С. и др. Микрофлора человека и роль современных пробиотиков в ее регуляции // Здоровье женщины. - 2004. - № 1 (17). - С. 134-139Бухарова Е.В., Попкова С.М., Ракова Е.Б., Джиоев Ю.П. и др. Детекция некоторых генетических маркеров факторов патогенности в аутоштаммах Klebsiella spp. у детей первого года жизни // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2014. - № 2 (96). - С. 58-62Бухарова Е.В., Попкова С.М., Ракова Е.Б., Джиоев Ю.П. и др. Детекция некоторых генетических маркеров факторов патогенности в аутоштаммах Klebsiella spp. у детей первого года жизни // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2014. - № 2 (96). - С. 58-62Варичев А.Н., Соловьёва И.В., Гелашвили Д.Б. Ранговые распределения численности сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки здоровых и больных людей разных возрастных групп // Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. - 2012. - № 2 (3). - С. 34-40Варичев А.Н., Соловьёва И.В., Гелашвили Д.Б. Ранговые распределения численности сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки здоровых и больных людей разных возрастных групп // Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. - 2012. - № 2 (3). - С. 34-40Диагностика, профилактика и лечение дисбактериозов кишечника: Метод. рек. - М., 1991. - 15 сДиагностика, профилактика и лечение дисбактериозов кишечника: Метод. рек. - М., 1991. - 15 сДука Е.Д. Диагностика и коррекция дисбиозов кишечника у детей // Здоровье ребенка. - 2010. - № 2 (23). - С. 47-51Дука Е.Д. Диагностика и коррекция дисбиозов кишечника у детей // Здоровье ребенка. - 2010. - № 2 (23). - С. 47-51Иванова Е.И. Формирование патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli в ассоциативном симбиозе толстой кишки у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта: автореф. дис. ... канд. биол. наук. - Иркутск, 2014. - 22 сИванова Е.И. Формирование патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli в ассоциативном симбиозе толстой кишки у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта: автореф. дис. ... канд. биол. наук. - Иркутск, 2014. - 22 сИванова Е.И. Формирование патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli в ассоциативном симбиозе толстой кишки у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта: дис. ... канд. биол. наук. - Иркутск, 2014. - 125 сИванова Е.И. Формирование патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli в ассоциативном симбиозе толстой кишки у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта: дис. ... канд. биол. наук. - Иркутск, 2014. - 125 сИванова Е.И., Джиоев Ю.П., Попкова С.М. Детекция генетических детерминант токсинообразования (stxl, stx2) у штаммов Escherichia coli // Глобализация науки: проблемы и перспективы: матер. междунар. научно-практич. конф. - Уфа: РИЦ БашГУ 2014. - Ч. 1. - С. 136-138Иванова Е.И., Джиоев Ю.П., Попкова С.М. Детекция генетических детерминант токсинообразования (stxl, stx2) у штаммов Escherichia coli // Глобализация науки: проблемы и перспективы: матер. междунар. научно-практич. конф. - Уфа: РИЦ БашГУ 2014. - Ч. 1. - С. 136-138Иванова Е.И., Попкова С.М., Джиоев Ю.П., Ракова Е.Б. Выявление генов патогенности, кодирующих способность к токсинообразованию, у штаммов Escherichia coli, выделенных из кишечного биотопа детей // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2013. - № 2 (90), Ч. 2. - C. 111-114Иванова Е.И., Попкова С.М., Джиоев Ю.П., Ракова Е.Б. Выявление генов патогенности, кодирующих способность к токсинообразованию, у штаммов Escherichia coli, выделенных из кишечного биотопа детей // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2013. - № 2 (90), Ч. 2. - C. 111-114Иванова Е.И., Попкова С.М., Джиоев Ю.П., Ракова Е.Б. Определение генетических детерминант патогенности у гемолизирующих Escherichia coli // Инфекция и иммунитет. - 2014. - С. 68-69Иванова Е.И., Попкова С.М., Джиоев Ю.П., Ракова Е.Б. Определение генетических детерминант патогенности у гемолизирующих Escherichia coli // Инфекция и иммунитет. - 2014. - С. 68-69Методики клинических лабораторных исследований: Справочное пособие. клиническая микробиология. Бактериологические исследования. Микологические исследования. Паразитологические исследования. Инфекционная иммунодиагностика. Молекулярные исследования в диагностике инфекционных заболеваний / под ред. В.В. Меньшикова. - М.: Лабора, 2009. - Т. 3. - С. 71-141Методики клинических лабораторных исследований: Справочное пособие. клиническая микробиология. Бактериологические исследования. Микологические исследования. Паразитологические исследования. Инфекционная иммунодиагностика. Молекулярные исследования в диагностике инфекционных заболеваний / под ред. В.В. Меньшикова. - М.: Лабора, 2009. - Т. 3. - С. 71-141Немченко У.М., Попкова С.М., Горбунова Е.Л., Петрова И.В. и др. Микроэкологический пейзаж кишечного биоценоза у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2011. - № 5 (81). - С. 89-93Немченко У.М., Попкова С.М., Горбунова Е.Л., Петрова И.В. и др. Микроэкологический пейзаж кишечного биоценоза у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2011. - № 5 (81). - С. 89-93Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» // ОСТ 1500.11.0004-2003. Приказ МЗ РФ No 231 от 09.06.2003Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» // ОСТ 1500.11.0004-2003. Приказ МЗ РФ No 231 от 09.06.2003Alfredo G.T., Vazquez-Juarez R.C., Christopher B.T., Garcia-Gallegos J.G. Pathoadaptive mutation that mediates adherence of shiga toxin-producing Escherichia coli O111 // Infection and immunity. - 2005. - Vol. 73, N 8. - P. 47664776.Alfredo G.T., Vazquez-Juarez R.C., Christopher B.T., Garcia-Gallegos J.G. Pathoadaptive mutation that mediates adherence of shiga toxin-producing Escherichia coli O111 // Infection and immunity. - 2005. - Vol. 73, N 8. - P. 47664776.Blanco M., Blanco J.E., Mora A., Rey J. et al. Serotypes, virulence genes, and intimin types of shiga toxin (verotoxin)-producing Escherichia coli isolates from healthy sheep in Spain // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 4. - P. 1351-1356.Blanco M., Blanco J.E., Mora A., Rey J. et al. Serotypes, virulence genes, and intimin types of shiga toxin (verotoxin)-producing Escherichia coli isolates from healthy sheep in Spain // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 4. - P. 1351-1356.Bouguenec C.L., Servin A.L. Diffusely adherent Escherichia coli strains expressing Afa/Dr adhesins (Afa/ Dr DAEC): hitherto unrecognized pathogens // FEMS Microbiology Letters. - 2006. - Vol. 256, Issue 2. - P. 185-194.Bouguenec C.L., Servin A.L. Diffusely adherent Escherichia coli strains expressing Afa/Dr adhesins (Afa/ Dr DAEC): hitherto unrecognized pathogens // FEMS Microbiology Letters. - 2006. - Vol. 256, Issue 2. - P. 185-194.Croxen M.A., Finlay B.B. Molecular mechanisms of Escherichia coli pathogenicity // Nature Reviews Microbiology. - 2010. - Vol. 8. - P. 26-38.Croxen M.A., Finlay B.B. Molecular mechanisms of Escherichia coli pathogenicity // Nature Reviews Microbiology. - 2010. - Vol. 8. - P. 26-38.Gunzburg S.T., Tornieporth N.G., Riley L.W. Identification of Enteropathogenic Escherichia coli by PCR-based detection of the bundle-forming pilus gene // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33, N 5. - P. 13751377.Gunzburg S.T., Tornieporth N.G., Riley L.W. Identification of Enteropathogenic Escherichia coli by PCR-based detection of the bundle-forming pilus gene // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33, N 5. - P. 13751377.Ochman H., Lawrence J.G., Groisman E.A. Lateral gene transfer and the nature of bacterial innovation // Nature. - 2000. - Vol. 405. - P. 299-304.Ochman H., Lawrence J.G., Groisman E.A. Lateral gene transfer and the nature of bacterial innovation // Nature. - 2000. - Vol. 405. - P. 299-304.Schultsz C., Pool G.J., Ketel R., Wever B. et al. Detection of Enterotoxigenic Escherichia coli in stool samples by using nonradioactively labeled oligonucleotide DNA probes and PCR // J. Clin. Microbiol. - 1994. - Vol. 32, N 10. - P. 2393-2397.Schultsz C., Pool G.J., Ketel R., Wever B. et al. Detection of Enterotoxigenic Escherichia coli in stool samples by using nonradioactively labeled oligonucleotide DNA probes and PCR // J. Clin. Microbiol. - 1994. - Vol. 32, N 10. - P. 2393-2397.Sokurenko E.V., Hasty D.L., Dykhuizen D.E. Pathoadaptive mutations: gene loss and variation in bacterial pathogens // Trends Microbiol. - 1999. - Vol. 7. - P. 191-195.Sokurenko E.V., Hasty D.L., Dykhuizen D.E. Pathoadaptive mutations: gene loss and variation in bacterial pathogens // Trends Microbiol. - 1999. - Vol. 7. - P. 191-195.Tornieporth N.G., John J., Salgado K., Jesus P. et al. Differentiation of pathogenic Escherichia coli strains in Brazilian children by PCR // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33, N 5. - P. 1371-1374.Tornieporth N.G., John J., Salgado K., Jesus P. et al. Differentiation of pathogenic Escherichia coli strains in Brazilian children by PCR // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33, N 5. - P. 1371-1374.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.