actabiomedicaActa Biomedica ScientificaActa Biomedica Scientifica2541-94202587-9596Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problemsactabiomedica-1720Research ArticleЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЕEXPERIMENTAL RESEARCHES IN BIOLOGY AND MEDICINEMLVA-ТИПИРОВАНИЕ В АНАЛИЗЕ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИИ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ПРИМОРСКОГО КРАЯ В ПЕРИОД ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО БЛАГОПОЛУЧИЯMLVA-TYPINGIN THE ANALYSIS of THE POPULATION STRUCTURE of VIBRIO CHOLERAE, CIRCULATING IN PRIMORSKY KRAI TERRITORY, DURING EPIDEMIOLOGICAL WELFAREХунхееваЖ. Ю.KhunkheevaZ. Y.noemail@neicon.ruМироноваЛ. В.MironovaL. V.mironova-lv@yandex.ruАфанасьевМ. В.AfanasjevM. V.afanasev-max@mail.ruПономареваА. С.PonomarevaA. S.noemail@neicon.ruУрбановичЛ. Я.UrbanovichL. Y.noemail@neicon.ruХоменкоТ. В.KhomenkoT. V.noemail@neicon.ruКимА. С.KimA. S.noemail@neicon.ruБорзовВ. П.BorzovV. P.noemail@neicon.ruАлленовА. В.AllenovA. V.noemail@neicon.ruБалахоновС. В.BalakhonovS. V.noemail@neicon.ruФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт РоспотребнадзораIrkutsk Antiplague Research Institute of Siberia and Far EastФКУЗ Приморская ПЧС РоспотребнадзораVladivostok branch of Primorsky Antiplague StationФКУЗ Приморская ПЧС РоспотребнадзораPrimorsky Antiplague Station201428022014018489Copyright © Хунхеева Ж.Ю., Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Пономарева А.С., Урбанович Л.Я., Хоменко Т.В., Ким А.С., Борзов В.П., Алленов А.В., Балахонов С.В., 20142014Хунхеева Ж.Ю., Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Пономарева А.С., Урбанович Л.Я., Хоменко Т.В., Ким А.С., Борзов В.П., Алленов А.В., Балахонов С.В.Khunkheeva Z.Y., Mironova L.V., Afanasjev M.V., Ponomareva A.S., Urbanovich L.Y., Khomenko T.V., Kim A.S., Borzov V.P., Allenov A.V., Balakhonov S.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/1720

С целью изучения популяционной структуры штаммов Vibrio cholerae, циркулирующих в водоемах Приморского края в период эпидемиологического благополучия проведено ретроспективное MLVA-типирование 50 культур, изолированных с 1976 по 2011 гг. В результате выявлена гетерогенность нетоксигенных V cholerae, заключающаяся в вариабельности структуры исследуемых локусов тандемных повторов. Показано, что на фоне эпидемиологического благополучия в водоемах Приморского края циркулируют V. cholerae, представленные не менее чем 30 уникальными и 8 кластерными генотипами. Метод MLVA-типирования обладает высокой дискриминирующей способностью в отношении исследуемых изолятов, индекс Хантера-Гастона составляет 0,988. В отдельных случаях выявлена взаимосвязь генотипа (идентичные и близкородственные аллельные профили) со временем и местом выделения штаммов V cholerae.

In order to study the population structure of Vibrio cholerae, circulating in the waters of Primorsky Region territory during epidemiological welfare, was carried out a retrospective MLVA-typing of 50 V.cholerae strains isolated since 1976 up to 2011 years. There was revealed non-toxigenic V. cholerae strains heterogeneity, consisting in the variability of structure of these tandem repeat loci. The waters circulation of Primorsky Region territory during epidemiological welfare V.cholerae, submitted by no less than 30 unique genotypes and 8 clusters is represented. There is a high discriminatory power of the MLVA. The Hunter Gaston index of isolates studied is 0.988. In some cases, was revealed relationship between genotype (identical and closely related allelic profiles) with time and place of V.cholerae strains isolation.

эпидемиологическое благополучие аллельный профильпопуляционная структураVibrio choleraeMLVA-типированиеVibrio choleraeMLVA-typingepidemiological welfareallelic profilepopulation structureReferencesБалахонов С.В., Миронова Л.В., Урбанович Л.Я. и др. К использованию ПЦР для детекции маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae // Генная диагностика особо опасных инфекций : Материалы 1-й Всероссийской научно-практ. конф. - Саратов, 2000. - С. 23-26.Балахонов С.В., Миронова Л.В., Урбанович Л.Я. и др. К использованию ПЦР для детекции маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae // Генная диагностика особо опасных инфекций : Материалы 1-й Всероссийской научно-практ. конф. - Саратов, 2000. - С. 23-26.Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю. и др. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae // Биотехнология. - 2001. -№ 6. - С. 85-88.Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю. и др. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae // Биотехнология. - 2001. -№ 6. - С. 85-88.Марамович А.С., Урбанович Л.Я., Ганин В.С., Миронова Л.В. и др. Холера в Сибири и на Дальнем Востоке на этапах VII пандемии // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 116-123.Марамович А.С., Урбанович Л.Я., Ганин В.С., Миронова Л.В. и др. Холера в Сибири и на Дальнем Востоке на этапах VII пандемии // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 116-123.Марамович А.С. Научное обоснование системы эпидемиологического надзора за холерой в условиях Сибири и Дальнего Востока : дис.. докт. мед. наук: 14.00.30. - Иркутск, 1983. - 402 с.Марамович А.С. Научное обоснование системы эпидемиологического надзора за холерой в условиях Сибири и Дальнего Востока : дис.. докт. мед. наук: 14.00.30. - Иркутск, 1983. - 402 с.Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я. и др. Определение геномных маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae, выделенных в Сибири и на Дальнем Востоке // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 132-138.Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я. и др. Определение геномных маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae, выделенных в Сибири и на Дальнем Востоке // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2004. - № 1, Т. 2. - С. 132-138.Мурначев Г.П., Марамович А.С., Маслов Д.В., Алленов А.В. Холера в Приморье: Эколого-эпидемиологические аспекты - Владивосток, 2009. - 279 с.Мурначев Г.П., Марамович А.С., Маслов Д.В., Алленов А.В. Холера в Приморье: Эколого-эпидемиологические аспекты - Владивосток, 2009. - 279 с.Онищенко Г.Г., Марамович А.С., Голубинский Е.П., Урбанович Л.Я. и др. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщение 1. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Владивостоке // Журн. микробиол. - 2000. - № 5. - С. 26-31.Онищенко Г.Г., Марамович А.С., Голубинский Е.П., Урбанович Л.Я. и др. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщение 1. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Владивостоке // Журн. микробиол. - 2000. - № 5. - С. 26-31.Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H., Broza Y.Y. et al. Vibrio cholerae Strain Typing and Phylogeny Study Based on Simple Sequence Repeats // J. Clin. Microbiol. - 2007. -Vol. 45, N 3. - P. 736-746.Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H., Broza Y.Y. et al. Vibrio cholerae Strain Typing and Phylogeny Study Based on Simple Sequence Repeats // J. Clin. Microbiol. - 2007. -Vol. 45, N 3. - P. 736-746.Ghosh R., Nair G.B., Tang L., Morris J.G. et al. Epidemiological study of Vibrio cholerae using variable number of tandem repeats // FEMS Microbiol Lett. - 2008. -N 288. - P. 196-201.Ghosh R., Nair G.B., Tang L., Morris J.G. et al. Epidemiological study of Vibrio cholerae using variable number of tandem repeats // FEMS Microbiol Lett. - 2008. -N 288. - P. 196-201.Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity // J. Clin. Microbiol. - 1988. -Vol. 26 (11). - P. 2465-2466.Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity // J. Clin. Microbiol. - 1988. -Vol. 26 (11). - P. 2465-2466.Kendall E.A., Chowdhury F., Begum Y., Khan A.I. et al. Relatedness of Vibrio cholerae 01/0139 isolates from patients and their household contacts, determined by multilocus - variable number tandem repeat analysis // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 17. - P. 4367-4376.Kendall E.A., Chowdhury F., Begum Y., Khan A.I. et al. Relatedness of Vibrio cholerae 01/0139 isolates from patients and their household contacts, determined by multilocus - variable number tandem repeat analysis // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 17. - P. 4367-4376.Ryan E.T. Haiti in the context of the current global cholera pandemic // Emerging Infectious Diseases. -2011. - Vol. 17, N 11. - P. 2175-2176.Ryan E.T. Haiti in the context of the current global cholera pandemic // Emerging Infectious Diseases. -2011. - Vol. 17, N 11. - P. 2175-2176.Satcher D. Emerging infections: getting ahead of the curve // Emerging Infectious Diseases. - 1995. - Vol. 1, N 1. - P. 1-6Satcher D. Emerging infections: getting ahead of the curve // Emerging Infectious Diseases. - 1995. - Vol. 1, N 1. - P. 1-6Selander R.K., Caugant D.A., Ochman H., Musser J.M. et al. Methods of multilocus enzyme electrophoresis for bacterial population genetics and systematic // Appl. Environ. Microbiol. - 1986. - Vol. 51. - P. 873-884.Selander R.K., Caugant D.A., Ochman H., Musser J.M. et al. Methods of multilocus enzyme electrophoresis for bacterial population genetics and systematic // Appl. Environ. Microbiol. - 1986. - Vol. 51. - P. 873-884.Weekly epidemiological record. - 2013. - Vol. 88, N 31 - P. 321-336.Weekly epidemiological record. - 2013. - Vol. 88, N 31 - P. 321-336.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.