actabiomedicaActa Biomedica ScientificaActa Biomedica Scientifica2541-94202587-9596Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problemsactabiomedica-1460Research ArticleПРОФИЛАКТИЧЕСКАЯ МЕДИЦИНАPREVENTIVE MEDICINEГЕНЕТИЧЕСКАЯ И ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ОРИГИНАЛЬНОГО ВАРИАНТА ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА («ГРУППА 886»), ЦИРКУЛИРУЮЩЕГО В БАЙКАЛЬСКОМ РЕГИОНЕGENETIC AND ECOLOGICAL CHARACTERISTICS AN ORIGINAL VARIANT BORNE ENCEPHALITIS VIRUS (THE «GROUP 886»), CIRCULATING IN THE BAIKAL REGIONПарамоновА. И.ParamonovA. I.paramonov_a.i@mail.ruКозловаИ. В.KozlovaI. V.noemail@neicon.ruВерхозинаМ. М.VerkhozinaM. M.noemail@neicon.ruДжиоевЮ. П.DzhioevYu. P.noemail@neicon.ruДеминаТ. В.DeminaT. V.demina2006@mail.ruДорощенкоЕ. К.DoroschenkoE. K.noemail@neicon.ruЛисакО. В.LisakO. V.noemail@neicon.ruФедулинаО. О.FedulinaO. O.noemail@neicon.ruФГБУ «Научный центр проблем здоровья и семьи и репродукции человека» СО РАМНScientific Center of Family Health Problems and Human Reproduction SB RAMSФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области»Center of Hygiene and Epidemiology in the Irkutsk regioГБОУ ВПО «Иркутский государственный медицинский университет» Минздрава РФState Medical University20132804201302(2)124129Copyright © Парамонов А.И., Козлова И.В., Верхозина М.М., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Федулина О.О., 20132013Парамонов А.И., Козлова И.В., Верхозина М.М., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Федулина О.О.Paramonov A.I., Kozlova I.V., Verkhozina M.M., Dzhioev Y.P., Demina T.V., Doroschenko E.K., Lisak O.V., Fedulina O.O.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/1460

Получены новые данные об оригинальном варианте вируса клещевого энцефалита (ВКЭ), циркулирующем на территории Восточной Сибири. С помощью молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот (МгнК) и секвенирования геномов выявлена группа из 13 штаммов, имеющих генетическую структуру, аналогичную штамму 886-84, который был описан нами ранее как единственный вероятный представитель генотипа 5. Формирование отдельного кластера на филогенетическом древе, дифференцирующий уровень генетических отличий от других генотипов - более 12 %, наличие собственного ареала, экологическая связь со всеми звеньями трансмиссивной цепи, участие в патологии человека, стабильность и длительность циркуляции в природе подтверждают правомерность аттестации «группы 886» в качестве самостоятельного генотипа 5 ВКЭ. Показано, что для мест изоляции штаммов «группы 886» характерно совмещение нескольких ландшафтных формаций, значительное разнообразие флоры и фауны.

New data was obtained about the original version of tickborne encephalitis virus (TBE), circulating in the territory of Eastern Siberia. With the help of molecular hybridization of nucleic acids (MGNA) and genome sequencing we revealed a group of 13 strains having a genetic structure analogous to strain 886-84, which was described earlier as the sole representative of the probable genotype 5. The formation of a separate cluster on the phylogenetic tree, differentiation level of genetic differences from other genotypes more than 12 %, own habitat, ecological relationship with all the links of a vector-borne chain, participation in human pathology, the stability and duration of circulation in nature confirms the validity of certification of «group 886» as a separate TBEV genotype 5.

вирус клещевого энцефалиташтаммы вируса клещевого энцефалита «группы 886»tick-borne encephalitis virus«group 886» strains of tick-borne encephalitis virusReferencesАндаев Е.И., Сидорова Е.А., Борисова Т.И. и др. Клещевой энцефалит в Забайкальском крае и молекулярно-биологическая характеристика возбудителя // Национальные приоритеты России (Специальный выпуск). - 2011. - № 2 (5). - С. 148-150.Андаев Е.И., Сидорова Е.А., Борисова Т.И. и др. Клещевой энцефалит в Забайкальском крае и молекулярно-биологическая характеристика возбудителя // Национальные приоритеты России (Специальный выпуск). - 2011. - № 2 (5). - С. 148-150.Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М. и др. Генетическая вариабельность и генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью дезоксиолигонуклеотидных зондов // Вопр. вирусол. - 2009. -№ 3. - С. 33-42.Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М. и др. Генетическая вариабельность и генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью дезоксиолигонуклеотидных зондов // Вопр. вирусол. - 2009. -№ 3. - С. 33-42.Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В. и др. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов и возможный сценарий их формирования // Вопр. вирусол. - 2012. - № 4. -С. 12-19.Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В. и др. Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов и возможный сценарий их формирования // Вопр. вирусол. - 2012. - № 4. -С. 12-19.Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита / Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН. - 2003. - 272 с.Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита / Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН. - 2003. - 272 с.Злобин В.И., Демина Т.В., Беликов С.И. и др. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента гена белка оболочки // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. -С. 16-21.Злобин В.И., Демина Т.В., Беликов С.И. и др. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента гена белка оболочки // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. -С. 16-21.Злобин В.И., Демина Т.В., Мамаев Л.В. и др. Анализ генетической вариабельности штаммов вируса клещевого энцефалита по первичной структуре фрагмента гена белка оболочки Е // Вопр. вирусол. -2001. - № 1. - С. 2-16.Злобин В.И., Демина Т.В., Мамаев Л.В. и др. Анализ генетической вариабельности штаммов вируса клещевого энцефалита по первичной структуре фрагмента гена белка оболочки Е // Вопр. вирусол. -2001. - № 1. - С. 2-16.Карань Л.С., Маленко Г.В., Бочкова Н.Г. и др. Применение молекулярно-генетических методов для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 34-40.Карань Л.С., Маленко Г.В., Бочкова Н.Г. и др. Применение молекулярно-генетических методов для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 34-40.Трухина А.Г. Особенности циркуляции возбудителя КЭ в зоне распространения двух серотипов вируса на территории Прибайкалья: дис.. к.м.н. -Иркутск, 1989. - 176 с.Трухина А.Г. Особенности циркуляции возбудителя КЭ в зоне распространения двух серотипов вируса на территории Прибайкалья: дис.. к.м.н. -Иркутск, 1989. - 176 с.Ecker M., Allison S.L., Meixner T. et al. Sequence analysis and genetic classification of tick-borne encephalitis viruses from Europe and Asia // J. Gen. Virol. - 1999. -Jan; 80 (Pt 1).Ecker M., Allison S.L., Meixner T. et al. Sequence analysis and genetic classification of tick-borne encephalitis viruses from Europe and Asia // J. Gen. Virol. - 1999. -Jan; 80 (Pt 1).Heinz F.X., Collet M.S., Purcell R.H. et al. Family Flaviviridae / Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: 7 report of the International committee of taxonomy of viruses. - San Diego, 2000. - P. 1217-1225.Heinz F.X., Collet M.S., Purcell R.H. et al. Family Flaviviridae / Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: 7 report of the International committee of taxonomy of viruses. - San Diego, 2000. - P. 1217-1225.Khasnatinov M.A., Danchinova G.A., Unursaikhan U. et al. Characterizaition of tick borne encephalitis virus that caused the lethal meningoencephalitis human in Mongolia / Inter. Conference Zoonotic Infections Disease and Тourism. - Ulaanbaatar, 2009. - P. 88-93.Khasnatinov M.A., Danchinova G.A., Unursaikhan U. et al. Characterizaition of tick borne encephalitis virus that caused the lethal meningoencephalitis human in Mongolia / Inter. Conference Zoonotic Infections Disease and Тourism. - Ulaanbaatar, 2009. - P. 88-93.Loktev VB, Ternovoi VA, Netesov SV. Molecular genetic characteristics of tick-borne encephalitis virus // Vopr Virusol. - 2007. - Sep-Oct; 52 (5).Loktev VB, Ternovoi VA, Netesov SV. Molecular genetic characteristics of tick-borne encephalitis virus // Vopr Virusol. - 2007. - Sep-Oct; 52 (5).Pletnev A.G., Yamshikov V.F., Blinov V.M. Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-bofrne encephalitis virus // Virology. - 1990. - V. 174.- P. 250-263.Pletnev A.G., Yamshikov V.F., Blinov V.M. Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-bofrne encephalitis virus // Virology. - 1990. - V. 174.- P. 250-263.Subbotina EL, Loktev VB. Molecular evolution of the tick-borne encephalitis and Powassan viruses. // Mol Biol. - 2012. - Jan-Feb, 46 (1). - P. 82-92.Subbotina EL, Loktev VB. Molecular evolution of the tick-borne encephalitis and Powassan viruses. // Mol Biol. - 2012. - Jan-Feb, 46 (1). - P. 82-92.Tamura K, Peterson D, Peterson N. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Molecular Biology and Evolution. - 2011. - Vol. 28 (10). - P. 2731-2739.Tamura K, Peterson D, Peterson N. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Molecular Biology and Evolution. - 2011. - Vol. 28 (10). - P. 2731-2739.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.