<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">actabiomedica</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Acta Biomedica Scientifica</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Acta Biomedica Scientifica</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2541-9420</issn><issn pub-type="epub">2587-9596</issn><publisher><publisher-name>Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">actabiomedica-1121</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЕ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>EXPERIMENTAL RESEARCHES IN BIOLOGY AND MEDICINE</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>ОСОБЕННОСТИ ГЕНОТИПИЧЕСКОЙ ИЗМЕНЧИВОСТИ ШТАММОВ BORDETELLA PERTUSSIS, ВЫДЕЛЕННЫХ ОТ БОЛЬНЫХ КОКЛЮШЕМ В РОССИИ</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>FEATURES OF GENOTYPiNG VARIABILITY OF STRAINS OF BORDETELLA PERTUSSIS ALLOCATED FROM PATIENTS WITH WHOOPING COUGH IN RUSSIA</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Алешкин</surname><given-names>В. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Aleshkin</surname><given-names>V. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Борисова</surname><given-names>О. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Borisova</surname><given-names>O. Yu.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">olgborisova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гадуа</surname><given-names>Н. Т.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gadua</surname><given-names>N. T.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Мазурова</surname><given-names>И. К.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Mazurova</surname><given-names>I. K.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского</institution></aff><aff xml:lang="en"><institution>G.N. Gabrichevsky Institute of Epidemiology and Microbiology</institution></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2012</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>28</day><month>09</month><year>2012</year></pub-date><volume>0</volume><issue>5(1)</issue><fpage>177</fpage><lpage>183</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Алешкин В.А., Борисова О.Ю., Гадуа Н.Т., Мазурова И.К., 2012</copyright-statement><copyright-year>2012</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Алешкин В.А., Борисова О.Ю., Гадуа Н.Т., Мазурова И.К.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Aleshkin V.A., Borisova O.Y., Gadua N.T., Mazurova I.K.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/1121">https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/1121</self-uri><abstract><p>На основании изучения особенностей структуры 7 генов, детерминирующих основные факторы патогенности возбудителя, коклюша, - ptxA, кодирующего S1 субъединицу А-комплекса; ptxB, ptxC, ptxD и ptxE, кодирующих S2, S3, S4 и S5 субъединицы. В-комплекса коклюшного токсина, его промоторной области (ptxP), и prn, кодирующего пертактин, показаны особенности генотипической изменчивости штаммов B. pertussis, выделенных от больных коклюшем в России. Прослежена динамика формирования популяции штаммов возбудителя коклюша и установлено, что популяция формируется путем клональной экспансии штаммов с новой генетической структурой основных факторов патогенности. - коклюшного токсина и пертактина. Установлен состав популяции штаммов B.pertussis, вызывающих заболевание коклюшем на современном этапе эпидемического процесса коклюшной инфекции -доминирование штаммов с новыми «невакцинными» аллелями генов - ptxAl (97,7 %), ptxC2 (87,4 %), prn2 (89,5 %) и ptxP3 (93,3 %), в 2,2 % случаях с ptxB2 аллелем и в 1,3 % случаях с prn9 аллелем.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>On the basis of studying of features of structure of 7 genes determining major factors of pathogenicity of the causative agent of whooping cough - ptxA, ptxB, ptxC, ptxD, ptxE, ptxP and prn, features of genotyping variability of strains of B.pertussis allocated from patients with whooping cough in Russia are shown. Dynamics of formation of population of strains of the causative agent of whooping cough is tracked and is established that population of strains of B.pertussis is formed by clonal expansion of strains with, new genetic structure of major factors of pathogenicity - pertussis toxin and. pertactin. The structure of population of strains of B.pertussis causing a disease by whooping cough, at the present stage of epidemic process of a pertussis infection - domination. of strains with new «non-vaccine» alleles genes - ptxA1 (97,7 %), ptxC2 (87,4 %), prn2 (89,5 %) and. ptxP3 (93,3 %), in 2,2 % cases with ptxB2 allele and. in 1,3 % cases with. prn9 allele circulate.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>генотипирование</kwd><kwd>ген</kwd><kwd>аллели</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Bordetella pertussis</kwd><kwd>Bordetella pertussis</kwd><kwd>genotyping</kwd><kwd>gene</kwd><kwd>alleles</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Analysis of Bordetella pertussis Populations in European Countries with Different Vaccination Policies / S.C.M. van Amersfoorth [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2005. - N 43. - P. 2837 - 2843.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Analysis of Bordetella pertussis Populations in European Countries with Different Vaccination Policies / S.C.M. van Amersfoorth [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2005. - N 43. - P. 2837 - 2843.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Analysis of Swedish Bordetella pertussis isolates with three typing methods: characterization of an epidemic lineage / A. Advani [et al.] // J. of Microbiological Methods. - 2009. - Vol. 78. -P. 297 - 301.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Analysis of Swedish Bordetella pertussis isolates with three typing methods: characterization of an epidemic lineage / A. Advani [et al.] // J. of Microbiological Methods. - 2009. - Vol. 78. -P. 297 - 301.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Antigenic divergence between B. pertussis clinical isolates from Moscow, Russia, and vaccine strains / O. Borisova [et al.] // J. Clin. and Vaccine Immunology. - 2007. - Vol. 14, N 28. - P. 234 - 238.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Antigenic divergence between B. pertussis clinical isolates from Moscow, Russia, and vaccine strains / O. Borisova [et al.] // J. Clin. and Vaccine Immunology. - 2007. - Vol. 14, N 28. - P. 234 - 238.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Antigenic variants in Bordetella pertussis strains isolated from vaccinated and unvaccinated children / P. Mastrantonio [et al.] // Microbiology. - 1999. -Vol. 145. - P. 2069 - 2075.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Antigenic variants in Bordetella pertussis strains isolated from vaccinated and unvaccinated children / P. Mastrantonio [et al.] // Microbiology. - 1999. -Vol. 145. - P. 2069 - 2075.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">B. pertussis strains circulating in Europe in 1999 to 2004 as determined by pulsed-field gel electrophoresis / H. Hallander [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol. 45, N 10. - P. 3257 - 3262.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">B. pertussis strains circulating in Europe in 1999 to 2004 as determined by pulsed-field gel electrophoresis / H. Hallander [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol. 45, N 10. - P. 3257 - 3262.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bordetella pertussis with increased pertussis toxin production associated with pertussis resurgence / F.R. Mooi [et al.] // Emerg. Infect. Dis. - 2009. -Vol. 15. - P. 1206-1213.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bordetella pertussis with increased pertussis toxin production associated with pertussis resurgence / F.R. Mooi [et al.] // Emerg. Infect. Dis. - 2009. -Vol. 15. - P. 1206-1213.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Comparison of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis Isolates circulating in Saint Petersburg between 1998 and 2000 with Russian vaccine strains / N. Kourova [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - N 41. - P. 3706 - 3711.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Comparison of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis Isolates circulating in Saint Petersburg between 1998 and 2000 with Russian vaccine strains / N. Kourova [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - N 41. - P. 3706 - 3711.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Human T cell clones define S1 subunit as the most immunogenic moiety of pertussis toxin and determine its epitope map / M.T. de Magistrics [et al.] // J. Exp. Med. - 1989. - Vol. 169. - P. 1519 -1532.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Human T cell clones define S1 subunit as the most immunogenic moiety of pertussis toxin and determine its epitope map / M.T. de Magistrics [et al.] // J. Exp. Med. - 1989. - Vol. 169. - P. 1519 -1532.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Identification and characterization of a protective immunodominant B cell epitope of pertactin (P. 69) from Bordetella pertussis / I.G. Charles [et al.] // Eur. J. Immunology. - 1991. - Vol. 21. -P. 1147-1153.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Identification and characterization of a protective immunodominant B cell epitope of pertactin (P. 69) from Bordetella pertussis / I.G. Charles [et al.] // Eur. J. Immunology. - 1991. - Vol. 21. -P. 1147-1153.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mooi F.R. Bordetella pertussis and vaccination: The persistence of a genetically monomorphic pathogen // J. Infection, genetics and evolution. -2009. - P. 1 - 14.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mooi F.R. Bordetella pertussis and vaccination: The persistence of a genetically monomorphic pathogen // J. Infection, genetics and evolution. -2009. - P. 1 - 14.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Polymorphism in Bordetella pertussis pertactin and pertussis toxin virulence factors in the United States, 1935-1999 / P. Cassiday [et al.] // J. Infect. Dis. - 2000. - Vol. 182. - P. 1402-1408.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Polymorphism in Bordetella pertussis pertactin and pertussis toxin virulence factors in the United States, 1935-1999 / P. Cassiday [et al.] // J. Infect. Dis. - 2000. - Vol. 182. - P. 1402-1408.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Resurgence of pertussis in Europe / L.P. Celentano [et al.] // J. Pediatr. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 24 (9). - P. 761 -765.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Resurgence of pertussis in Europe / L.P. Celentano [et al.] // J. Pediatr. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 24 (9). - P. 761 -765.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Role of the polymorphic region 1 of the Bordetella pertussis protein pertactin in immunity / A.J. King [et al.] // J. Microbiology. - 2001. -Vol. 147. - P. 2885 - 2895.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Role of the polymorphic region 1 of the Bordetella pertussis protein pertactin in immunity / A.J. King [et al.] // J. Microbiology. - 2001. -Vol. 147. - P. 2885 - 2895.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sequence variation and conservation in virulence-related genes of Bordetella pertussis isolates from the UK / E.R. Packard [et al.] // J. Med Microb. -2004. - N 53. - P. 355 - 365.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sequence variation and conservation in virulence-related genes of Bordetella pertussis isolates from the UK / E.R. Packard [et al.] // J. Med Microb. -2004. - N 53. - P. 355 - 365.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Герасимова А.Г., Петрова М.С., Тихонова Н.Т. Клинико-эпидемиологическая характеристика современного коклюша // Новости вакцинопрофилактики: Вакцинация. - 2004. - Т. 5, № 35. - С. 4 - 5.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Герасимова А.Г., Петрова М.С., Тихонова Н.Т. Клинико-эпидемиологическая характеристика современного коклюша // Новости вакцинопрофилактики: Вакцинация. - 2004. - Т. 5, № 35. - С. 4 - 5.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Динамика изменчивости основных генов патогенности штаммов Bordetella pertussis, выделенных от больных коклюшем в г. Москве (1948 -2005 гг.) / И.К. Мазурова [и др.] // Журнал молекулярной медицины. - 2008. - № 1. - С. 40 - 45.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Динамика изменчивости основных генов патогенности штаммов Bordetella pertussis, выделенных от больных коклюшем в г. Москве (1948 -2005 гг.) / И.К. Мазурова [и др.] // Журнал молекулярной медицины. - 2008. - № 1. - С. 40 - 45.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лыткина И.Н., Чистякова Г.Г., Филатов Н.Н. Заболеваемость коклюшем в Москве и организация мероприятий по ее снижению // Новости вакцинопрофилактики: Вакцинация. - 2004. - Т. 5, № 35. - С. 8 - 9.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Лыткина И.Н., Чистякова Г.Г., Филатов Н.Н. Заболеваемость коклюшем в Москве и организация мероприятий по ее снижению // Новости вакцинопрофилактики: Вакцинация. - 2004. - Т. 5, № 35. - С. 8 - 9.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Bordetella pertussis, выделенных в различные периоды эпидемического процесса коклюшной инфекции / И.К. Мазурова [и др.] // Ж. молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2005. - № 4. - С. 21-25.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Bordetella pertussis, выделенных в различные периоды эпидемического процесса коклюшной инфекции / И.К. Мазурова [и др.] // Ж. молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2005. - № 4. - С. 21-25.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Особенности коклюшной инфекции в различные периоды эпидемического процесса в г. Москве / О.Ю. Борисова [и др.] // Журнал эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2010. -№ 4. - С. 33 - 39.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Особенности коклюшной инфекции в различные периоды эпидемического процесса в г. Москве / О.Ю. Борисова [и др.] // Журнал эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2010. -№ 4. - С. 33 - 39.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Особенности эпидемиологии и клиники коклюша в период эпидемического неблагополучия / М.С. Петрова [и др.] // Проблемы ин фекционных болезней: сб. научн. тр. - 2000. - Ч. 1. - С. 80 - 86.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Особенности эпидемиологии и клиники коклюша в период эпидемического неблагополучия / М.С. Петрова [и др.] // Проблемы ин фекционных болезней: сб. научн. тр. - 2000. - Ч. 1. - С. 80 - 86.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Особенности эпидемического процесса коклюшной инфекции в Москве на современном этапе / Г.Г. Чистякова [и др.] // ЖМЭИ. - 2005. -№ 5. - С. 35 - 40.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Особенности эпидемического процесса коклюшной инфекции в Москве на современном этапе / Г.Г. Чистякова [и др.] // ЖМЭИ. - 2005. -№ 5. - С. 35 - 40.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit22"><label>22</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Семенов Б.Ф., Захарова Н.С., Мазурова И.К. Подъем заболеваемости коклюшем на фоне массовой вакцинации. Гипотезы, объясняющие этот феномен // ЖМЭИ. - 2003. - № 6. -С. 70 - 73.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Семенов Б.Ф., Захарова Н.С., Мазурова И.К. Подъем заболеваемости коклюшем на фоне массовой вакцинации. Гипотезы, объясняющие этот феномен // ЖМЭИ. - 2003. - № 6. -С. 70 - 73.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit23"><label>23</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Сигаева Л.А., Кузнецова Л.С., Окиншевич Е.А. Заболеваемость коклюшем и состояние привитости // Ж. микробиологии. - 1986. - № 3. - С. 43 - 47.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Сигаева Л.А., Кузнецова Л.С., Окиншевич Е.А. Заболеваемость коклюшем и состояние привитости // Ж. микробиологии. - 1986. - № 3. - С. 43 - 47.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
